Protein–RNA interactions for Protein: Q99J36

Thumpd1, THUMP domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thumpd1Q99J36 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Thumpd1Q99J36 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Thumpd1Q99J36 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Thumpd1Q99J36 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Thumpd1Q99J36 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Thumpd1Q99J36 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Thumpd1Q99J36 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Thumpd1Q99J36 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Thumpd1Q99J36 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Thumpd1Q99J36 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Thumpd1Q99J36 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Thumpd1Q99J36 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Thumpd1Q99J36 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Thumpd1Q99J36 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Thumpd1Q99J36 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Thumpd1Q99J36 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Thumpd1Q99J36 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Thumpd1Q99J36 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Thumpd1Q99J36 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Thumpd1Q99J36 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Thumpd1Q99J36 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Thumpd1Q99J36 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Thumpd1Q99J36 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Thumpd1Q99J36 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Thumpd1Q99J36 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Thumpd1Q99J36 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Thumpd1Q99J36 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Thumpd1Q99J36 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Thumpd1Q99J36 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Thumpd1Q99J36 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Thumpd1Q99J36 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Thumpd1Q99J36 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Thumpd1Q99J36 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Thumpd1Q99J36 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Thumpd1Q99J36 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Thumpd1Q99J36 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Thumpd1Q99J36 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Thumpd1Q99J36 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Thumpd1Q99J36 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Thumpd1Q99J36 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Thumpd1Q99J36 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Thumpd1Q99J36 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Thumpd1Q99J36 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Thumpd1Q99J36 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Thumpd1Q99J36 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Thumpd1Q99J36 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Thumpd1Q99J36 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Thumpd1Q99J36 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Thumpd1Q99J36 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Thumpd1Q99J36 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Thumpd1Q99J36 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Thumpd1Q99J36 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Thumpd1Q99J36 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Thumpd1Q99J36 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Thumpd1Q99J36 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Thumpd1Q99J36 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Thumpd1Q99J36 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Thumpd1Q99J36 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Thumpd1Q99J36 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Thumpd1Q99J36 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Thumpd1Q99J36 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Thumpd1Q99J36 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Thumpd1Q99J36 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Thumpd1Q99J36 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Thumpd1Q99J36 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Thumpd1Q99J36 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Thumpd1Q99J36 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Thumpd1Q99J36 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Thumpd1Q99J36 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Thumpd1Q99J36 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Thumpd1Q99J36 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Thumpd1Q99J36 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Thumpd1Q99J36 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Thumpd1Q99J36 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Thumpd1Q99J36 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Thumpd1Q99J36 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Thumpd1Q99J36 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Thumpd1Q99J36 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Thumpd1Q99J36 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Thumpd1Q99J36 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Thumpd1Q99J36 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Thumpd1Q99J36 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Thumpd1Q99J36 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Thumpd1Q99J36 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Thumpd1Q99J36 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Thumpd1Q99J36 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Thumpd1Q99J36 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Thumpd1Q99J36 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Thumpd1Q99J36 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Thumpd1Q99J36 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Thumpd1Q99J36 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Thumpd1Q99J36 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Thumpd1Q99J36 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Thumpd1Q99J36 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Thumpd1Q99J36 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Thumpd1Q99J36 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Thumpd1Q99J36 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Thumpd1Q99J36 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Thumpd1Q99J36 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Thumpd1Q99J36 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms