Protein–RNA interactions for Protein: Q99J27

Slc33a1, Acetyl-coenzyme A transporter 1, mousemouse

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc33a1Q99J27 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Slc33a1Q99J27 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Slc33a1Q99J27 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Slc33a1Q99J27 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Slc33a1Q99J27 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slc33a1Q99J27 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Slc33a1Q99J27 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slc33a1Q99J27 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slc33a1Q99J27 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Slc33a1Q99J27 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Slc33a1Q99J27 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Slc33a1Q99J27 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Slc33a1Q99J27 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Slc33a1Q99J27 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Slc33a1Q99J27 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Slc33a1Q99J27 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Slc33a1Q99J27 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slc33a1Q99J27 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Slc33a1Q99J27 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Slc33a1Q99J27 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Slc33a1Q99J27 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Slc33a1Q99J27 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Slc33a1Q99J27 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slc33a1Q99J27 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Slc33a1Q99J27 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slc33a1Q99J27 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Slc33a1Q99J27 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slc33a1Q99J27 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slc33a1Q99J27 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slc33a1Q99J27 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slc33a1Q99J27 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slc33a1Q99J27 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slc33a1Q99J27 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slc33a1Q99J27 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slc33a1Q99J27 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slc33a1Q99J27 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slc33a1Q99J27 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slc33a1Q99J27 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Slc33a1Q99J27 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slc33a1Q99J27 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Slc33a1Q99J27 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slc33a1Q99J27 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slc33a1Q99J27 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slc33a1Q99J27 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slc33a1Q99J27 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slc33a1Q99J27 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Slc33a1Q99J27 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slc33a1Q99J27 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Slc33a1Q99J27 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slc33a1Q99J27 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Slc33a1Q99J27 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
Slc33a1Q99J27 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slc33a1Q99J27 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slc33a1Q99J27 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slc33a1Q99J27 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slc33a1Q99J27 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Slc33a1Q99J27 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Slc33a1Q99J27 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slc33a1Q99J27 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slc33a1Q99J27 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slc33a1Q99J27 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slc33a1Q99J27 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slc33a1Q99J27 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Slc33a1Q99J27 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Slc33a1Q99J27 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Slc33a1Q99J27 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Slc33a1Q99J27 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Slc33a1Q99J27 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Slc33a1Q99J27 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Slc33a1Q99J27 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Slc33a1Q99J27 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Slc33a1Q99J27 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Slc33a1Q99J27 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Slc33a1Q99J27 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Slc33a1Q99J27 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Slc33a1Q99J27 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Slc33a1Q99J27 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Slc33a1Q99J27 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Slc33a1Q99J27 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Slc33a1Q99J27 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Slc33a1Q99J27 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Slc33a1Q99J27 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Slc33a1Q99J27 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Slc33a1Q99J27 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Slc33a1Q99J27 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Slc33a1Q99J27 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Slc33a1Q99J27 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Slc33a1Q99J27 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Slc33a1Q99J27 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Slc33a1Q99J27 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Slc33a1Q99J27 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Slc33a1Q99J27 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Slc33a1Q99J27 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Slc33a1Q99J27 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Slc33a1Q99J27 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Slc33a1Q99J27 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Slc33a1Q99J27 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Slc33a1Q99J27 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Slc33a1Q99J27 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Slc33a1Q99J27 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms