Protein–RNA interactions for Protein: Q921F2

Tardbp, TAR DNA-binding protein 43, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TardbpQ921F2 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TardbpQ921F2 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TardbpQ921F2 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TardbpQ921F2 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TardbpQ921F2 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
TardbpQ921F2 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
TardbpQ921F2 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TardbpQ921F2 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TardbpQ921F2 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TardbpQ921F2 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TardbpQ921F2 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TardbpQ921F2 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TardbpQ921F2 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TardbpQ921F2 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TardbpQ921F2 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
TardbpQ921F2 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TardbpQ921F2 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TardbpQ921F2 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TardbpQ921F2 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TardbpQ921F2 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TardbpQ921F2 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TardbpQ921F2 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TardbpQ921F2 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TardbpQ921F2 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
TardbpQ921F2 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TardbpQ921F2 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TardbpQ921F2 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TardbpQ921F2 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TardbpQ921F2 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TardbpQ921F2 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TardbpQ921F2 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
TardbpQ921F2 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TardbpQ921F2 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TardbpQ921F2 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TardbpQ921F2 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TardbpQ921F2 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TardbpQ921F2 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TardbpQ921F2 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TardbpQ921F2 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TardbpQ921F2 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
TardbpQ921F2 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TardbpQ921F2 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TardbpQ921F2 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TardbpQ921F2 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TardbpQ921F2 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TardbpQ921F2 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TardbpQ921F2 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TardbpQ921F2 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TardbpQ921F2 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TardbpQ921F2 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
TardbpQ921F2 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TardbpQ921F2 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TardbpQ921F2 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TardbpQ921F2 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TardbpQ921F2 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TardbpQ921F2 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TardbpQ921F2 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TardbpQ921F2 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TardbpQ921F2 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TardbpQ921F2 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
TardbpQ921F2 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TardbpQ921F2 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TardbpQ921F2 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TardbpQ921F2 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TardbpQ921F2 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TardbpQ921F2 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TardbpQ921F2 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TardbpQ921F2 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TardbpQ921F2 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TardbpQ921F2 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TardbpQ921F2 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TardbpQ921F2 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TardbpQ921F2 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TardbpQ921F2 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TardbpQ921F2 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TardbpQ921F2 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TardbpQ921F2 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TardbpQ921F2 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TardbpQ921F2 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TardbpQ921F2 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
TardbpQ921F2 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TardbpQ921F2 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TardbpQ921F2 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TardbpQ921F2 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TardbpQ921F2 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TardbpQ921F2 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TardbpQ921F2 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
TardbpQ921F2 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TardbpQ921F2 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TardbpQ921F2 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
TardbpQ921F2 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TardbpQ921F2 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TardbpQ921F2 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TardbpQ921F2 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TardbpQ921F2 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TardbpQ921F2 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TardbpQ921F2 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TardbpQ921F2 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TardbpQ921F2 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TardbpQ921F2 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms