Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZR2

Snx18, Sorting nexin-18, mousemouse

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx18Q91ZR2 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Snx18Q91ZR2 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Snx18Q91ZR2 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Snx18Q91ZR2 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Snx18Q91ZR2 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Snx18Q91ZR2 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Snx18Q91ZR2 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Snx18Q91ZR2 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Snx18Q91ZR2 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Snx18Q91ZR2 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Snx18Q91ZR2 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Snx18Q91ZR2 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Snx18Q91ZR2 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Snx18Q91ZR2 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Snx18Q91ZR2 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Snx18Q91ZR2 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Snx18Q91ZR2 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Snx18Q91ZR2 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Snx18Q91ZR2 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Snx18Q91ZR2 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Snx18Q91ZR2 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Snx18Q91ZR2 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Snx18Q91ZR2 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Snx18Q91ZR2 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Snx18Q91ZR2 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Snx18Q91ZR2 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Snx18Q91ZR2 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Snx18Q91ZR2 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Snx18Q91ZR2 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Snx18Q91ZR2 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Snx18Q91ZR2 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Snx18Q91ZR2 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Snx18Q91ZR2 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Snx18Q91ZR2 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Snx18Q91ZR2 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Snx18Q91ZR2 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Snx18Q91ZR2 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Snx18Q91ZR2 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Snx18Q91ZR2 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Snx18Q91ZR2 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Snx18Q91ZR2 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Snx18Q91ZR2 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Snx18Q91ZR2 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Snx18Q91ZR2 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Snx18Q91ZR2 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Snx18Q91ZR2 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Snx18Q91ZR2 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
Snx18Q91ZR2 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Snx18Q91ZR2 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Snx18Q91ZR2 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Snx18Q91ZR2 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Snx18Q91ZR2 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Snx18Q91ZR2 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Snx18Q91ZR2 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Snx18Q91ZR2 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Snx18Q91ZR2 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Snx18Q91ZR2 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Snx18Q91ZR2 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Snx18Q91ZR2 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Snx18Q91ZR2 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Snx18Q91ZR2 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Snx18Q91ZR2 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Snx18Q91ZR2 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Snx18Q91ZR2 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Snx18Q91ZR2 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Snx18Q91ZR2 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Snx18Q91ZR2 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Snx18Q91ZR2 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Snx18Q91ZR2 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Snx18Q91ZR2 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Snx18Q91ZR2 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Snx18Q91ZR2 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Snx18Q91ZR2 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Snx18Q91ZR2 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Snx18Q91ZR2 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Snx18Q91ZR2 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Snx18Q91ZR2 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Snx18Q91ZR2 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Snx18Q91ZR2 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Snx18Q91ZR2 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Snx18Q91ZR2 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Snx18Q91ZR2 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Snx18Q91ZR2 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Snx18Q91ZR2 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Snx18Q91ZR2 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Snx18Q91ZR2 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Snx18Q91ZR2 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Snx18Q91ZR2 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Snx18Q91ZR2 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Snx18Q91ZR2 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Snx18Q91ZR2 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Snx18Q91ZR2 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Snx18Q91ZR2 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Snx18Q91ZR2 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Snx18Q91ZR2 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Snx18Q91ZR2 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Snx18Q91ZR2 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Snx18Q91ZR2 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Snx18Q91ZR2 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Snx18Q91ZR2 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms