Protein–RNA interactions for Protein: Q91WT8

Rbm47, RNA-binding protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm47Q91WT8 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Rbm47Q91WT8 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Rbm47Q91WT8 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Rbm47Q91WT8 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Rbm47Q91WT8 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Rbm47Q91WT8 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Rbm47Q91WT8 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Rbm47Q91WT8 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Rbm47Q91WT8 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Rbm47Q91WT8 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Rbm47Q91WT8 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Rbm47Q91WT8 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Rbm47Q91WT8 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Rbm47Q91WT8 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Rbm47Q91WT8 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Rbm47Q91WT8 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Rbm47Q91WT8 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Rbm47Q91WT8 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Rbm47Q91WT8 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Rbm47Q91WT8 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Rbm47Q91WT8 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Rbm47Q91WT8 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Rbm47Q91WT8 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Rbm47Q91WT8 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Rbm47Q91WT8 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Rbm47Q91WT8 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Rbm47Q91WT8 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Rbm47Q91WT8 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Rbm47Q91WT8 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rbm47Q91WT8 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Rbm47Q91WT8 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Rbm47Q91WT8 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Rbm47Q91WT8 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Rbm47Q91WT8 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rbm47Q91WT8 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rbm47Q91WT8 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rbm47Q91WT8 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rbm47Q91WT8 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rbm47Q91WT8 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rbm47Q91WT8 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rbm47Q91WT8 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rbm47Q91WT8 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rbm47Q91WT8 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rbm47Q91WT8 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rbm47Q91WT8 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rbm47Q91WT8 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rbm47Q91WT8 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Rbm47Q91WT8 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Rbm47Q91WT8 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Rbm47Q91WT8 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Rbm47Q91WT8 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Rbm47Q91WT8 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rbm47Q91WT8 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rbm47Q91WT8 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rbm47Q91WT8 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rbm47Q91WT8 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rbm47Q91WT8 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rbm47Q91WT8 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rbm47Q91WT8 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Rbm47Q91WT8 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
Rbm47Q91WT8 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rbm47Q91WT8 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rbm47Q91WT8 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Rbm47Q91WT8 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rbm47Q91WT8 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rbm47Q91WT8 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Rbm47Q91WT8 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rbm47Q91WT8 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rbm47Q91WT8 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rbm47Q91WT8 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rbm47Q91WT8 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rbm47Q91WT8 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rbm47Q91WT8 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rbm47Q91WT8 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Rbm47Q91WT8 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Rbm47Q91WT8 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rbm47Q91WT8 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rbm47Q91WT8 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rbm47Q91WT8 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rbm47Q91WT8 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rbm47Q91WT8 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rbm47Q91WT8 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rbm47Q91WT8 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Rbm47Q91WT8 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Rbm47Q91WT8 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Rbm47Q91WT8 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Rbm47Q91WT8 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Rbm47Q91WT8 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Rbm47Q91WT8 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Rbm47Q91WT8 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rbm47Q91WT8 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rbm47Q91WT8 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Rbm47Q91WT8 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rbm47Q91WT8 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Rbm47Q91WT8 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
Rbm47Q91WT8 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Rbm47Q91WT8 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rbm47Q91WT8 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rbm47Q91WT8 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rbm47Q91WT8 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 302.3 ms