Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHW4

Cacng5, Voltage-dependent calcium channel gamma-5 subunit, mousemouse

Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacng5Q8VHW4 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cacng5Q8VHW4 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cacng5Q8VHW4 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cacng5Q8VHW4 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cacng5Q8VHW4 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cacng5Q8VHW4 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cacng5Q8VHW4 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cacng5Q8VHW4 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cacng5Q8VHW4 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cacng5Q8VHW4 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cacng5Q8VHW4 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cacng5Q8VHW4 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cacng5Q8VHW4 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cacng5Q8VHW4 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Cacng5Q8VHW4 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cacng5Q8VHW4 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cacng5Q8VHW4 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cacng5Q8VHW4 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cacng5Q8VHW4 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Cacng5Q8VHW4 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cacng5Q8VHW4 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cacng5Q8VHW4 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cacng5Q8VHW4 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cacng5Q8VHW4 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cacng5Q8VHW4 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cacng5Q8VHW4 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cacng5Q8VHW4 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cacng5Q8VHW4 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cacng5Q8VHW4 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cacng5Q8VHW4 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Cacng5Q8VHW4 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Cacng5Q8VHW4 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cacng5Q8VHW4 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cacng5Q8VHW4 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cacng5Q8VHW4 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cacng5Q8VHW4 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cacng5Q8VHW4 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Cacng5Q8VHW4 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cacng5Q8VHW4 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cacng5Q8VHW4 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cacng5Q8VHW4 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cacng5Q8VHW4 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cacng5Q8VHW4 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cacng5Q8VHW4 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Cacng5Q8VHW4 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cacng5Q8VHW4 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cacng5Q8VHW4 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cacng5Q8VHW4 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cacng5Q8VHW4 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Cacng5Q8VHW4 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Cacng5Q8VHW4 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cacng5Q8VHW4 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cacng5Q8VHW4 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cacng5Q8VHW4 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cacng5Q8VHW4 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cacng5Q8VHW4 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cacng5Q8VHW4 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Cacng5Q8VHW4 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cacng5Q8VHW4 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cacng5Q8VHW4 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cacng5Q8VHW4 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Cacng5Q8VHW4 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cacng5Q8VHW4 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cacng5Q8VHW4 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cacng5Q8VHW4 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Cacng5Q8VHW4 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cacng5Q8VHW4 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cacng5Q8VHW4 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cacng5Q8VHW4 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cacng5Q8VHW4 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cacng5Q8VHW4 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cacng5Q8VHW4 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cacng5Q8VHW4 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Cacng5Q8VHW4 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cacng5Q8VHW4 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cacng5Q8VHW4 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cacng5Q8VHW4 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cacng5Q8VHW4 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cacng5Q8VHW4 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cacng5Q8VHW4 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cacng5Q8VHW4 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cacng5Q8VHW4 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cacng5Q8VHW4 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cacng5Q8VHW4 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cacng5Q8VHW4 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cacng5Q8VHW4 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cacng5Q8VHW4 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Cacng5Q8VHW4 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cacng5Q8VHW4 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cacng5Q8VHW4 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cacng5Q8VHW4 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cacng5Q8VHW4 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cacng5Q8VHW4 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cacng5Q8VHW4 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cacng5Q8VHW4 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cacng5Q8VHW4 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Cacng5Q8VHW4 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cacng5Q8VHW4 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cacng5Q8VHW4 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cacng5Q8VHW4 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.2 ms