Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHC3

Selenom, Selenoprotein M, mousemouse

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SelenomQ8VHC3 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SelenomQ8VHC3 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SelenomQ8VHC3 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SelenomQ8VHC3 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SelenomQ8VHC3 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SelenomQ8VHC3 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SelenomQ8VHC3 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
SelenomQ8VHC3 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SelenomQ8VHC3 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SelenomQ8VHC3 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SelenomQ8VHC3 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SelenomQ8VHC3 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SelenomQ8VHC3 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SelenomQ8VHC3 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SelenomQ8VHC3 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SelenomQ8VHC3 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SelenomQ8VHC3 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SelenomQ8VHC3 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SelenomQ8VHC3 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SelenomQ8VHC3 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SelenomQ8VHC3 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SelenomQ8VHC3 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SelenomQ8VHC3 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SelenomQ8VHC3 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
SelenomQ8VHC3 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
SelenomQ8VHC3 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SelenomQ8VHC3 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SelenomQ8VHC3 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SelenomQ8VHC3 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SelenomQ8VHC3 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SelenomQ8VHC3 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SelenomQ8VHC3 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SelenomQ8VHC3 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SelenomQ8VHC3 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SelenomQ8VHC3 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SelenomQ8VHC3 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SelenomQ8VHC3 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SelenomQ8VHC3 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SelenomQ8VHC3 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SelenomQ8VHC3 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SelenomQ8VHC3 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SelenomQ8VHC3 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SelenomQ8VHC3 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SelenomQ8VHC3 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SelenomQ8VHC3 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SelenomQ8VHC3 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SelenomQ8VHC3 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SelenomQ8VHC3 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SelenomQ8VHC3 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SelenomQ8VHC3 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SelenomQ8VHC3 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SelenomQ8VHC3 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SelenomQ8VHC3 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SelenomQ8VHC3 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SelenomQ8VHC3 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SelenomQ8VHC3 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SelenomQ8VHC3 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SelenomQ8VHC3 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SelenomQ8VHC3 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SelenomQ8VHC3 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SelenomQ8VHC3 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SelenomQ8VHC3 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SelenomQ8VHC3 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
SelenomQ8VHC3 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SelenomQ8VHC3 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SelenomQ8VHC3 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
SelenomQ8VHC3 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SelenomQ8VHC3 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SelenomQ8VHC3 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SelenomQ8VHC3 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SelenomQ8VHC3 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SelenomQ8VHC3 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SelenomQ8VHC3 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SelenomQ8VHC3 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SelenomQ8VHC3 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SelenomQ8VHC3 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SelenomQ8VHC3 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SelenomQ8VHC3 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SelenomQ8VHC3 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SelenomQ8VHC3 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SelenomQ8VHC3 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SelenomQ8VHC3 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SelenomQ8VHC3 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SelenomQ8VHC3 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SelenomQ8VHC3 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
SelenomQ8VHC3 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SelenomQ8VHC3 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SelenomQ8VHC3 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SelenomQ8VHC3 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SelenomQ8VHC3 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SelenomQ8VHC3 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SelenomQ8VHC3 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SelenomQ8VHC3 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SelenomQ8VHC3 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
SelenomQ8VHC3 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SelenomQ8VHC3 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SelenomQ8VHC3 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SelenomQ8VHC3 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SelenomQ8VHC3 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SelenomQ8VHC3 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.5 ms