Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDU1

Rhov, Rho-related GTP-binding protein RhoV, mousemouse

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhovQ8VDU1 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
RhovQ8VDU1 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
RhovQ8VDU1 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
RhovQ8VDU1 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RhovQ8VDU1 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
RhovQ8VDU1 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RhovQ8VDU1 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RhovQ8VDU1 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RhovQ8VDU1 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RhovQ8VDU1 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RhovQ8VDU1 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RhovQ8VDU1 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RhovQ8VDU1 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RhovQ8VDU1 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RhovQ8VDU1 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RhovQ8VDU1 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RhovQ8VDU1 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RhovQ8VDU1 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RhovQ8VDU1 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RhovQ8VDU1 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RhovQ8VDU1 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
RhovQ8VDU1 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RhovQ8VDU1 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RhovQ8VDU1 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RhovQ8VDU1 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RhovQ8VDU1 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
RhovQ8VDU1 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RhovQ8VDU1 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RhovQ8VDU1 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RhovQ8VDU1 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RhovQ8VDU1 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
RhovQ8VDU1 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RhovQ8VDU1 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RhovQ8VDU1 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RhovQ8VDU1 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RhovQ8VDU1 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RhovQ8VDU1 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RhovQ8VDU1 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RhovQ8VDU1 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RhovQ8VDU1 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RhovQ8VDU1 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RhovQ8VDU1 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
RhovQ8VDU1 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RhovQ8VDU1 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RhovQ8VDU1 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RhovQ8VDU1 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
RhovQ8VDU1 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RhovQ8VDU1 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RhovQ8VDU1 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC20.95■□□□□ 0.95
RhovQ8VDU1 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
RhovQ8VDU1 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RhovQ8VDU1 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
RhovQ8VDU1 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RhovQ8VDU1 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
RhovQ8VDU1 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RhovQ8VDU1 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RhovQ8VDU1 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RhovQ8VDU1 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
RhovQ8VDU1 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RhovQ8VDU1 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
RhovQ8VDU1 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
RhovQ8VDU1 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
RhovQ8VDU1 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
RhovQ8VDU1 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
RhovQ8VDU1 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RhovQ8VDU1 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RhovQ8VDU1 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
RhovQ8VDU1 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
RhovQ8VDU1 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
RhovQ8VDU1 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RhovQ8VDU1 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RhovQ8VDU1 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
RhovQ8VDU1 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
RhovQ8VDU1 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
RhovQ8VDU1 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RhovQ8VDU1 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RhovQ8VDU1 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RhovQ8VDU1 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
RhovQ8VDU1 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RhovQ8VDU1 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RhovQ8VDU1 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
RhovQ8VDU1 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
RhovQ8VDU1 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
RhovQ8VDU1 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
RhovQ8VDU1 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
RhovQ8VDU1 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
RhovQ8VDU1 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
RhovQ8VDU1 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
RhovQ8VDU1 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RhovQ8VDU1 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RhovQ8VDU1 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
RhovQ8VDU1 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
RhovQ8VDU1 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
RhovQ8VDU1 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
RhovQ8VDU1 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
RhovQ8VDU1 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
RhovQ8VDU1 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
RhovQ8VDU1 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
RhovQ8VDU1 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
RhovQ8VDU1 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms