Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDR7

Tgds, dTDP-D-glucose 4,6-dehydratase, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TgdsQ8VDR7 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TgdsQ8VDR7 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TgdsQ8VDR7 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TgdsQ8VDR7 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TgdsQ8VDR7 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TgdsQ8VDR7 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TgdsQ8VDR7 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TgdsQ8VDR7 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
TgdsQ8VDR7 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TgdsQ8VDR7 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TgdsQ8VDR7 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TgdsQ8VDR7 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TgdsQ8VDR7 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TgdsQ8VDR7 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TgdsQ8VDR7 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TgdsQ8VDR7 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TgdsQ8VDR7 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TgdsQ8VDR7 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
TgdsQ8VDR7 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TgdsQ8VDR7 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TgdsQ8VDR7 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TgdsQ8VDR7 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TgdsQ8VDR7 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TgdsQ8VDR7 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TgdsQ8VDR7 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TgdsQ8VDR7 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TgdsQ8VDR7 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TgdsQ8VDR7 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TgdsQ8VDR7 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TgdsQ8VDR7 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
TgdsQ8VDR7 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TgdsQ8VDR7 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
TgdsQ8VDR7 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TgdsQ8VDR7 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TgdsQ8VDR7 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TgdsQ8VDR7 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TgdsQ8VDR7 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TgdsQ8VDR7 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TgdsQ8VDR7 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TgdsQ8VDR7 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TgdsQ8VDR7 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TgdsQ8VDR7 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
TgdsQ8VDR7 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TgdsQ8VDR7 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TgdsQ8VDR7 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TgdsQ8VDR7 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TgdsQ8VDR7 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TgdsQ8VDR7 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TgdsQ8VDR7 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TgdsQ8VDR7 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TgdsQ8VDR7 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TgdsQ8VDR7 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TgdsQ8VDR7 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TgdsQ8VDR7 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TgdsQ8VDR7 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TgdsQ8VDR7 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TgdsQ8VDR7 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TgdsQ8VDR7 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TgdsQ8VDR7 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TgdsQ8VDR7 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TgdsQ8VDR7 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TgdsQ8VDR7 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TgdsQ8VDR7 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TgdsQ8VDR7 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
TgdsQ8VDR7 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TgdsQ8VDR7 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
TgdsQ8VDR7 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
TgdsQ8VDR7 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TgdsQ8VDR7 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TgdsQ8VDR7 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TgdsQ8VDR7 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TgdsQ8VDR7 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TgdsQ8VDR7 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TgdsQ8VDR7 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TgdsQ8VDR7 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TgdsQ8VDR7 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TgdsQ8VDR7 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TgdsQ8VDR7 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TgdsQ8VDR7 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
TgdsQ8VDR7 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TgdsQ8VDR7 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
TgdsQ8VDR7 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TgdsQ8VDR7 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TgdsQ8VDR7 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TgdsQ8VDR7 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TgdsQ8VDR7 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TgdsQ8VDR7 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TgdsQ8VDR7 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TgdsQ8VDR7 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TgdsQ8VDR7 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TgdsQ8VDR7 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TgdsQ8VDR7 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TgdsQ8VDR7 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
TgdsQ8VDR7 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TgdsQ8VDR7 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TgdsQ8VDR7 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TgdsQ8VDR7 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TgdsQ8VDR7 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TgdsQ8VDR7 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TgdsQ8VDR7 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.9 ms