Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCQ3

Nrbf2, Nuclear receptor-binding factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 287 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrbf2Q8VCQ3 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Nrbf2Q8VCQ3 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Nrbf2Q8VCQ3 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Nrbf2Q8VCQ3 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Nrbf2Q8VCQ3 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Nrbf2Q8VCQ3 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Nrbf2Q8VCQ3 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Nrbf2Q8VCQ3 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Nrbf2Q8VCQ3 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Nrbf2Q8VCQ3 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Nrbf2Q8VCQ3 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Nrbf2Q8VCQ3 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Nrbf2Q8VCQ3 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Nrbf2Q8VCQ3 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Nrbf2Q8VCQ3 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Nrbf2Q8VCQ3 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Nrbf2Q8VCQ3 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Nrbf2Q8VCQ3 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Nrbf2Q8VCQ3 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Nrbf2Q8VCQ3 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Nrbf2Q8VCQ3 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Nrbf2Q8VCQ3 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Nrbf2Q8VCQ3 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Nrbf2Q8VCQ3 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Nrbf2Q8VCQ3 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Nrbf2Q8VCQ3 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Nrbf2Q8VCQ3 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Nrbf2Q8VCQ3 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Nrbf2Q8VCQ3 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Nrbf2Q8VCQ3 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Nrbf2Q8VCQ3 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Nrbf2Q8VCQ3 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Nrbf2Q8VCQ3 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Nrbf2Q8VCQ3 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Nrbf2Q8VCQ3 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Nrbf2Q8VCQ3 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Nrbf2Q8VCQ3 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Nrbf2Q8VCQ3 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Nrbf2Q8VCQ3 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Nrbf2Q8VCQ3 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Nrbf2Q8VCQ3 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Nrbf2Q8VCQ3 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Nrbf2Q8VCQ3 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Nrbf2Q8VCQ3 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Nrbf2Q8VCQ3 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Nrbf2Q8VCQ3 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Nrbf2Q8VCQ3 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Nrbf2Q8VCQ3 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Nrbf2Q8VCQ3 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Nrbf2Q8VCQ3 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Nrbf2Q8VCQ3 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Nrbf2Q8VCQ3 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Nrbf2Q8VCQ3 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Nrbf2Q8VCQ3 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Nrbf2Q8VCQ3 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Nrbf2Q8VCQ3 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Nrbf2Q8VCQ3 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Nrbf2Q8VCQ3 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Nrbf2Q8VCQ3 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Nrbf2Q8VCQ3 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Nrbf2Q8VCQ3 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Nrbf2Q8VCQ3 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Nrbf2Q8VCQ3 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Nrbf2Q8VCQ3 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Nrbf2Q8VCQ3 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Nrbf2Q8VCQ3 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Nrbf2Q8VCQ3 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Nrbf2Q8VCQ3 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Nrbf2Q8VCQ3 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Nrbf2Q8VCQ3 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Nrbf2Q8VCQ3 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Nrbf2Q8VCQ3 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Nrbf2Q8VCQ3 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Nrbf2Q8VCQ3 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Nrbf2Q8VCQ3 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Nrbf2Q8VCQ3 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Nrbf2Q8VCQ3 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Nrbf2Q8VCQ3 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Nrbf2Q8VCQ3 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Nrbf2Q8VCQ3 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Nrbf2Q8VCQ3 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Nrbf2Q8VCQ3 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Nrbf2Q8VCQ3 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Nrbf2Q8VCQ3 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Nrbf2Q8VCQ3 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Nrbf2Q8VCQ3 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Nrbf2Q8VCQ3 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Nrbf2Q8VCQ3 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Nrbf2Q8VCQ3 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Nrbf2Q8VCQ3 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Nrbf2Q8VCQ3 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Nrbf2Q8VCQ3 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Nrbf2Q8VCQ3 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nrbf2Q8VCQ3 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Nrbf2Q8VCQ3 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Nrbf2Q8VCQ3 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Nrbf2Q8VCQ3 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nrbf2Q8VCQ3 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Nrbf2Q8VCQ3 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Nrbf2Q8VCQ3 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.2 ms