Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCQ3

Nrbf2, Nuclear receptor-binding factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 287 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrbf2Q8VCQ3 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Nrbf2Q8VCQ3 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Nrbf2Q8VCQ3 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Nrbf2Q8VCQ3 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Nrbf2Q8VCQ3 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Nrbf2Q8VCQ3 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Nrbf2Q8VCQ3 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Nrbf2Q8VCQ3 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Nrbf2Q8VCQ3 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Nrbf2Q8VCQ3 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Nrbf2Q8VCQ3 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Nrbf2Q8VCQ3 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Nrbf2Q8VCQ3 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Nrbf2Q8VCQ3 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Nrbf2Q8VCQ3 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Nrbf2Q8VCQ3 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Nrbf2Q8VCQ3 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Nrbf2Q8VCQ3 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Nrbf2Q8VCQ3 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Nrbf2Q8VCQ3 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Nrbf2Q8VCQ3 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Nrbf2Q8VCQ3 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Nrbf2Q8VCQ3 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Nrbf2Q8VCQ3 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Nrbf2Q8VCQ3 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Nrbf2Q8VCQ3 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Nrbf2Q8VCQ3 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Nrbf2Q8VCQ3 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Nrbf2Q8VCQ3 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Nrbf2Q8VCQ3 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Nrbf2Q8VCQ3 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Nrbf2Q8VCQ3 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Nrbf2Q8VCQ3 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Nrbf2Q8VCQ3 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Nrbf2Q8VCQ3 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Nrbf2Q8VCQ3 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Nrbf2Q8VCQ3 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Nrbf2Q8VCQ3 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Nrbf2Q8VCQ3 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Nrbf2Q8VCQ3 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Nrbf2Q8VCQ3 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Nrbf2Q8VCQ3 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Nrbf2Q8VCQ3 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Nrbf2Q8VCQ3 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Nrbf2Q8VCQ3 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Nrbf2Q8VCQ3 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Nrbf2Q8VCQ3 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Nrbf2Q8VCQ3 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Nrbf2Q8VCQ3 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Nrbf2Q8VCQ3 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Nrbf2Q8VCQ3 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Nrbf2Q8VCQ3 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Nrbf2Q8VCQ3 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Nrbf2Q8VCQ3 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Nrbf2Q8VCQ3 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Nrbf2Q8VCQ3 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Nrbf2Q8VCQ3 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Nrbf2Q8VCQ3 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Nrbf2Q8VCQ3 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Nrbf2Q8VCQ3 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Nrbf2Q8VCQ3 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Nrbf2Q8VCQ3 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Nrbf2Q8VCQ3 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Nrbf2Q8VCQ3 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Nrbf2Q8VCQ3 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Nrbf2Q8VCQ3 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Nrbf2Q8VCQ3 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Nrbf2Q8VCQ3 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Nrbf2Q8VCQ3 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Nrbf2Q8VCQ3 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Nrbf2Q8VCQ3 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Nrbf2Q8VCQ3 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Nrbf2Q8VCQ3 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Nrbf2Q8VCQ3 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Nrbf2Q8VCQ3 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Nrbf2Q8VCQ3 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Nrbf2Q8VCQ3 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Nrbf2Q8VCQ3 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Nrbf2Q8VCQ3 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Nrbf2Q8VCQ3 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Nrbf2Q8VCQ3 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Nrbf2Q8VCQ3 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Nrbf2Q8VCQ3 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Nrbf2Q8VCQ3 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Nrbf2Q8VCQ3 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Nrbf2Q8VCQ3 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Nrbf2Q8VCQ3 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Nrbf2Q8VCQ3 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Nrbf2Q8VCQ3 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Nrbf2Q8VCQ3 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Nrbf2Q8VCQ3 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Nrbf2Q8VCQ3 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Nrbf2Q8VCQ3 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nrbf2Q8VCQ3 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Nrbf2Q8VCQ3 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Nrbf2Q8VCQ3 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Nrbf2Q8VCQ3 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nrbf2Q8VCQ3 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Nrbf2Q8VCQ3 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Nrbf2Q8VCQ3 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms