Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCF5

Tspan10, Tetraspanin-10, mousemouse

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan10Q8VCF5 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tspan10Q8VCF5 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tspan10Q8VCF5 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tspan10Q8VCF5 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tspan10Q8VCF5 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tspan10Q8VCF5 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tspan10Q8VCF5 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tspan10Q8VCF5 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tspan10Q8VCF5 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tspan10Q8VCF5 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tspan10Q8VCF5 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tspan10Q8VCF5 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tspan10Q8VCF5 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tspan10Q8VCF5 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Tspan10Q8VCF5 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tspan10Q8VCF5 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tspan10Q8VCF5 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tspan10Q8VCF5 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tspan10Q8VCF5 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tspan10Q8VCF5 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tspan10Q8VCF5 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tspan10Q8VCF5 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Tspan10Q8VCF5 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tspan10Q8VCF5 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tspan10Q8VCF5 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tspan10Q8VCF5 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Tspan10Q8VCF5 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tspan10Q8VCF5 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tspan10Q8VCF5 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Tspan10Q8VCF5 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tspan10Q8VCF5 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Tspan10Q8VCF5 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tspan10Q8VCF5 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tspan10Q8VCF5 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tspan10Q8VCF5 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Tspan10Q8VCF5 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tspan10Q8VCF5 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tspan10Q8VCF5 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tspan10Q8VCF5 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tspan10Q8VCF5 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tspan10Q8VCF5 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tspan10Q8VCF5 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tspan10Q8VCF5 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Tspan10Q8VCF5 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Tspan10Q8VCF5 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tspan10Q8VCF5 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tspan10Q8VCF5 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tspan10Q8VCF5 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tspan10Q8VCF5 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tspan10Q8VCF5 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tspan10Q8VCF5 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tspan10Q8VCF5 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tspan10Q8VCF5 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tspan10Q8VCF5 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tspan10Q8VCF5 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tspan10Q8VCF5 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Tspan10Q8VCF5 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tspan10Q8VCF5 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tspan10Q8VCF5 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tspan10Q8VCF5 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tspan10Q8VCF5 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tspan10Q8VCF5 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tspan10Q8VCF5 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tspan10Q8VCF5 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tspan10Q8VCF5 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tspan10Q8VCF5 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tspan10Q8VCF5 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tspan10Q8VCF5 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tspan10Q8VCF5 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tspan10Q8VCF5 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tspan10Q8VCF5 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tspan10Q8VCF5 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tspan10Q8VCF5 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tspan10Q8VCF5 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tspan10Q8VCF5 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tspan10Q8VCF5 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tspan10Q8VCF5 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Tspan10Q8VCF5 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Tspan10Q8VCF5 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tspan10Q8VCF5 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tspan10Q8VCF5 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tspan10Q8VCF5 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Tspan10Q8VCF5 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tspan10Q8VCF5 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tspan10Q8VCF5 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tspan10Q8VCF5 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tspan10Q8VCF5 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tspan10Q8VCF5 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tspan10Q8VCF5 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tspan10Q8VCF5 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tspan10Q8VCF5 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Tspan10Q8VCF5 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tspan10Q8VCF5 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tspan10Q8VCF5 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tspan10Q8VCF5 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tspan10Q8VCF5 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tspan10Q8VCF5 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tspan10Q8VCF5 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tspan10Q8VCF5 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tspan10Q8VCF5 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
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