Protein–RNA interactions for Protein: Q8VBW5

Bbx, HMG box transcription factor BBX, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BbxQ8VBW5 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
BbxQ8VBW5 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
BbxQ8VBW5 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
BbxQ8VBW5 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
BbxQ8VBW5 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
BbxQ8VBW5 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
BbxQ8VBW5 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
BbxQ8VBW5 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
BbxQ8VBW5 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
BbxQ8VBW5 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
BbxQ8VBW5 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
BbxQ8VBW5 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
BbxQ8VBW5 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
BbxQ8VBW5 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
BbxQ8VBW5 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
BbxQ8VBW5 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
BbxQ8VBW5 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
BbxQ8VBW5 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
BbxQ8VBW5 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
BbxQ8VBW5 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
BbxQ8VBW5 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
BbxQ8VBW5 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
BbxQ8VBW5 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
BbxQ8VBW5 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
BbxQ8VBW5 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
BbxQ8VBW5 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
BbxQ8VBW5 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
BbxQ8VBW5 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
BbxQ8VBW5 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
BbxQ8VBW5 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
BbxQ8VBW5 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
BbxQ8VBW5 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
BbxQ8VBW5 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
BbxQ8VBW5 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
BbxQ8VBW5 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
BbxQ8VBW5 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
BbxQ8VBW5 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
BbxQ8VBW5 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
BbxQ8VBW5 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
BbxQ8VBW5 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
BbxQ8VBW5 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
BbxQ8VBW5 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
BbxQ8VBW5 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
BbxQ8VBW5 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
BbxQ8VBW5 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
BbxQ8VBW5 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
BbxQ8VBW5 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
BbxQ8VBW5 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
BbxQ8VBW5 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
BbxQ8VBW5 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
BbxQ8VBW5 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
BbxQ8VBW5 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
BbxQ8VBW5 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
BbxQ8VBW5 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
BbxQ8VBW5 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
BbxQ8VBW5 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
BbxQ8VBW5 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
BbxQ8VBW5 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
BbxQ8VBW5 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
BbxQ8VBW5 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
BbxQ8VBW5 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
BbxQ8VBW5 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
BbxQ8VBW5 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
BbxQ8VBW5 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
BbxQ8VBW5 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
BbxQ8VBW5 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
BbxQ8VBW5 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
BbxQ8VBW5 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
BbxQ8VBW5 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
BbxQ8VBW5 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
BbxQ8VBW5 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
BbxQ8VBW5 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
BbxQ8VBW5 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
BbxQ8VBW5 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
BbxQ8VBW5 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
BbxQ8VBW5 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
BbxQ8VBW5 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
BbxQ8VBW5 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
BbxQ8VBW5 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
BbxQ8VBW5 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
BbxQ8VBW5 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
BbxQ8VBW5 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
BbxQ8VBW5 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
BbxQ8VBW5 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
BbxQ8VBW5 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
BbxQ8VBW5 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
BbxQ8VBW5 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
BbxQ8VBW5 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
BbxQ8VBW5 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
BbxQ8VBW5 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
BbxQ8VBW5 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
BbxQ8VBW5 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
BbxQ8VBW5 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
BbxQ8VBW5 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
BbxQ8VBW5 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
BbxQ8VBW5 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
BbxQ8VBW5 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
BbxQ8VBW5 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
BbxQ8VBW5 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
BbxQ8VBW5 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms