Protein–RNA interactions for Protein: Q8R2E6

V1ra11, Vomeronasal type-1 receptor A11, mousemouse

Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
V1ra11Q8R2E6 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
V1ra11Q8R2E6 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
V1ra11Q8R2E6 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
V1ra11Q8R2E6 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
V1ra11Q8R2E6 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
V1ra11Q8R2E6 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
V1ra11Q8R2E6 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
V1ra11Q8R2E6 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
V1ra11Q8R2E6 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
V1ra11Q8R2E6 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
V1ra11Q8R2E6 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
V1ra11Q8R2E6 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
V1ra11Q8R2E6 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
V1ra11Q8R2E6 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
V1ra11Q8R2E6 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
V1ra11Q8R2E6 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
V1ra11Q8R2E6 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
V1ra11Q8R2E6 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
V1ra11Q8R2E6 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
V1ra11Q8R2E6 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
V1ra11Q8R2E6 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
V1ra11Q8R2E6 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
V1ra11Q8R2E6 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
V1ra11Q8R2E6 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
V1ra11Q8R2E6 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
V1ra11Q8R2E6 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
V1ra11Q8R2E6 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
V1ra11Q8R2E6 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
V1ra11Q8R2E6 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
V1ra11Q8R2E6 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
V1ra11Q8R2E6 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
V1ra11Q8R2E6 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
V1ra11Q8R2E6 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
V1ra11Q8R2E6 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
V1ra11Q8R2E6 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
V1ra11Q8R2E6 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
V1ra11Q8R2E6 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
V1ra11Q8R2E6 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
V1ra11Q8R2E6 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
V1ra11Q8R2E6 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
V1ra11Q8R2E6 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
V1ra11Q8R2E6 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
V1ra11Q8R2E6 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
V1ra11Q8R2E6 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
V1ra11Q8R2E6 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
V1ra11Q8R2E6 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
V1ra11Q8R2E6 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
V1ra11Q8R2E6 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
V1ra11Q8R2E6 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
V1ra11Q8R2E6 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
V1ra11Q8R2E6 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
V1ra11Q8R2E6 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
V1ra11Q8R2E6 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
V1ra11Q8R2E6 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
V1ra11Q8R2E6 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
V1ra11Q8R2E6 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
V1ra11Q8R2E6 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
V1ra11Q8R2E6 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
V1ra11Q8R2E6 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
V1ra11Q8R2E6 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
V1ra11Q8R2E6 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
V1ra11Q8R2E6 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
V1ra11Q8R2E6 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
V1ra11Q8R2E6 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
V1ra11Q8R2E6 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
V1ra11Q8R2E6 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
V1ra11Q8R2E6 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
V1ra11Q8R2E6 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
V1ra11Q8R2E6 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
V1ra11Q8R2E6 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
V1ra11Q8R2E6 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
V1ra11Q8R2E6 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
V1ra11Q8R2E6 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
V1ra11Q8R2E6 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
V1ra11Q8R2E6 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
V1ra11Q8R2E6 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
V1ra11Q8R2E6 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
V1ra11Q8R2E6 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
V1ra11Q8R2E6 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
V1ra11Q8R2E6 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
V1ra11Q8R2E6 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
V1ra11Q8R2E6 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
V1ra11Q8R2E6 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
V1ra11Q8R2E6 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
V1ra11Q8R2E6 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
V1ra11Q8R2E6 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
V1ra11Q8R2E6 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
V1ra11Q8R2E6 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
V1ra11Q8R2E6 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
V1ra11Q8R2E6 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
V1ra11Q8R2E6 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
V1ra11Q8R2E6 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
V1ra11Q8R2E6 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
V1ra11Q8R2E6 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
V1ra11Q8R2E6 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
V1ra11Q8R2E6 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
V1ra11Q8R2E6 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
V1ra11Q8R2E6 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
V1ra11Q8R2E6 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
V1ra11Q8R2E6 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.6 ms