Protein–RNA interactions for Protein: Q8R268

Vmn1r212, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r212Q8R268 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Vmn1r212Q8R268 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Vmn1r212Q8R268 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Vmn1r212Q8R268 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Vmn1r212Q8R268 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Vmn1r212Q8R268 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Vmn1r212Q8R268 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Vmn1r212Q8R268 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Vmn1r212Q8R268 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Vmn1r212Q8R268 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Vmn1r212Q8R268 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Vmn1r212Q8R268 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Vmn1r212Q8R268 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Vmn1r212Q8R268 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Vmn1r212Q8R268 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Vmn1r212Q8R268 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Vmn1r212Q8R268 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Vmn1r212Q8R268 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Vmn1r212Q8R268 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Vmn1r212Q8R268 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Vmn1r212Q8R268 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Vmn1r212Q8R268 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Vmn1r212Q8R268 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Vmn1r212Q8R268 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Vmn1r212Q8R268 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Vmn1r212Q8R268 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Vmn1r212Q8R268 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Vmn1r212Q8R268 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Vmn1r212Q8R268 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Vmn1r212Q8R268 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Vmn1r212Q8R268 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Vmn1r212Q8R268 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Vmn1r212Q8R268 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Vmn1r212Q8R268 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Vmn1r212Q8R268 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Vmn1r212Q8R268 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Vmn1r212Q8R268 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Vmn1r212Q8R268 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Vmn1r212Q8R268 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Vmn1r212Q8R268 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Vmn1r212Q8R268 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Vmn1r212Q8R268 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Vmn1r212Q8R268 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Vmn1r212Q8R268 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Vmn1r212Q8R268 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Vmn1r212Q8R268 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Vmn1r212Q8R268 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Vmn1r212Q8R268 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Vmn1r212Q8R268 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Vmn1r212Q8R268 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Vmn1r212Q8R268 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Vmn1r212Q8R268 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Vmn1r212Q8R268 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Vmn1r212Q8R268 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Vmn1r212Q8R268 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Vmn1r212Q8R268 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Vmn1r212Q8R268 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Vmn1r212Q8R268 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Vmn1r212Q8R268 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Vmn1r212Q8R268 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Vmn1r212Q8R268 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Vmn1r212Q8R268 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Vmn1r212Q8R268 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Vmn1r212Q8R268 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Vmn1r212Q8R268 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Vmn1r212Q8R268 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Vmn1r212Q8R268 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Vmn1r212Q8R268 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Vmn1r212Q8R268 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Vmn1r212Q8R268 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Vmn1r212Q8R268 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Vmn1r212Q8R268 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Vmn1r212Q8R268 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Vmn1r212Q8R268 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Vmn1r212Q8R268 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Vmn1r212Q8R268 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Vmn1r212Q8R268 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Vmn1r212Q8R268 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Vmn1r212Q8R268 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Vmn1r212Q8R268 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Vmn1r212Q8R268 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Vmn1r212Q8R268 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Vmn1r212Q8R268 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Vmn1r212Q8R268 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Vmn1r212Q8R268 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Vmn1r212Q8R268 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Vmn1r212Q8R268 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Vmn1r212Q8R268 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Vmn1r212Q8R268 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Vmn1r212Q8R268 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Vmn1r212Q8R268 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Vmn1r212Q8R268 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Vmn1r212Q8R268 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Vmn1r212Q8R268 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Vmn1r212Q8R268 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Vmn1r212Q8R268 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Vmn1r212Q8R268 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Vmn1r212Q8R268 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Vmn1r212Q8R268 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Vmn1r212Q8R268 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.3 ms