Protein–RNA interactions for Protein: Q8R1B8

Rorb, Nuclear receptor ROR-beta, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RorbQ8R1B8 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RorbQ8R1B8 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RorbQ8R1B8 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RorbQ8R1B8 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RorbQ8R1B8 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RorbQ8R1B8 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RorbQ8R1B8 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RorbQ8R1B8 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
RorbQ8R1B8 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RorbQ8R1B8 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RorbQ8R1B8 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RorbQ8R1B8 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RorbQ8R1B8 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RorbQ8R1B8 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RorbQ8R1B8 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RorbQ8R1B8 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RorbQ8R1B8 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RorbQ8R1B8 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RorbQ8R1B8 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RorbQ8R1B8 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RorbQ8R1B8 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RorbQ8R1B8 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RorbQ8R1B8 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RorbQ8R1B8 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RorbQ8R1B8 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RorbQ8R1B8 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RorbQ8R1B8 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RorbQ8R1B8 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RorbQ8R1B8 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
RorbQ8R1B8 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RorbQ8R1B8 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RorbQ8R1B8 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RorbQ8R1B8 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RorbQ8R1B8 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RorbQ8R1B8 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
RorbQ8R1B8 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
RorbQ8R1B8 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RorbQ8R1B8 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RorbQ8R1B8 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RorbQ8R1B8 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RorbQ8R1B8 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RorbQ8R1B8 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RorbQ8R1B8 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RorbQ8R1B8 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RorbQ8R1B8 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RorbQ8R1B8 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RorbQ8R1B8 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RorbQ8R1B8 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RorbQ8R1B8 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
RorbQ8R1B8 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RorbQ8R1B8 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RorbQ8R1B8 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RorbQ8R1B8 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RorbQ8R1B8 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RorbQ8R1B8 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RorbQ8R1B8 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RorbQ8R1B8 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RorbQ8R1B8 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RorbQ8R1B8 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RorbQ8R1B8 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RorbQ8R1B8 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RorbQ8R1B8 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RorbQ8R1B8 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RorbQ8R1B8 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RorbQ8R1B8 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RorbQ8R1B8 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RorbQ8R1B8 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
RorbQ8R1B8 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RorbQ8R1B8 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RorbQ8R1B8 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RorbQ8R1B8 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RorbQ8R1B8 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RorbQ8R1B8 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RorbQ8R1B8 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RorbQ8R1B8 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RorbQ8R1B8 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RorbQ8R1B8 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RorbQ8R1B8 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RorbQ8R1B8 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RorbQ8R1B8 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RorbQ8R1B8 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RorbQ8R1B8 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RorbQ8R1B8 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RorbQ8R1B8 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RorbQ8R1B8 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RorbQ8R1B8 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RorbQ8R1B8 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RorbQ8R1B8 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RorbQ8R1B8 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RorbQ8R1B8 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RorbQ8R1B8 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RorbQ8R1B8 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RorbQ8R1B8 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
RorbQ8R1B8 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RorbQ8R1B8 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RorbQ8R1B8 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RorbQ8R1B8 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RorbQ8R1B8 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RorbQ8R1B8 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RorbQ8R1B8 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms