Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4N3

Defb12, Beta-defensin 12, mousemouse

Predictions only

Length 78 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defb12Q8K4N3 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Defb12Q8K4N3 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Defb12Q8K4N3 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Defb12Q8K4N3 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Defb12Q8K4N3 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Defb12Q8K4N3 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Defb12Q8K4N3 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Defb12Q8K4N3 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Defb12Q8K4N3 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Defb12Q8K4N3 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Defb12Q8K4N3 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Defb12Q8K4N3 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Defb12Q8K4N3 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Defb12Q8K4N3 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Defb12Q8K4N3 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Defb12Q8K4N3 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Defb12Q8K4N3 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Defb12Q8K4N3 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Defb12Q8K4N3 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Defb12Q8K4N3 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Defb12Q8K4N3 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Defb12Q8K4N3 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Defb12Q8K4N3 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Defb12Q8K4N3 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Defb12Q8K4N3 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Defb12Q8K4N3 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Defb12Q8K4N3 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Defb12Q8K4N3 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Defb12Q8K4N3 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Defb12Q8K4N3 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Defb12Q8K4N3 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Defb12Q8K4N3 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Defb12Q8K4N3 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Defb12Q8K4N3 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Defb12Q8K4N3 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Defb12Q8K4N3 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Defb12Q8K4N3 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Defb12Q8K4N3 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Defb12Q8K4N3 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Defb12Q8K4N3 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Defb12Q8K4N3 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Defb12Q8K4N3 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Defb12Q8K4N3 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Defb12Q8K4N3 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Defb12Q8K4N3 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Defb12Q8K4N3 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Defb12Q8K4N3 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Defb12Q8K4N3 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Defb12Q8K4N3 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Defb12Q8K4N3 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Defb12Q8K4N3 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Defb12Q8K4N3 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Defb12Q8K4N3 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Defb12Q8K4N3 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Defb12Q8K4N3 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Defb12Q8K4N3 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Defb12Q8K4N3 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Defb12Q8K4N3 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Defb12Q8K4N3 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Defb12Q8K4N3 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Defb12Q8K4N3 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Defb12Q8K4N3 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Defb12Q8K4N3 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Defb12Q8K4N3 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Defb12Q8K4N3 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Defb12Q8K4N3 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Defb12Q8K4N3 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Defb12Q8K4N3 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Defb12Q8K4N3 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Defb12Q8K4N3 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Defb12Q8K4N3 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Defb12Q8K4N3 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Defb12Q8K4N3 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Defb12Q8K4N3 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Defb12Q8K4N3 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Defb12Q8K4N3 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Defb12Q8K4N3 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Defb12Q8K4N3 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Defb12Q8K4N3 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Defb12Q8K4N3 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Defb12Q8K4N3 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Defb12Q8K4N3 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Defb12Q8K4N3 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Defb12Q8K4N3 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Defb12Q8K4N3 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Defb12Q8K4N3 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Defb12Q8K4N3 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Defb12Q8K4N3 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Defb12Q8K4N3 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Defb12Q8K4N3 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Defb12Q8K4N3 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Defb12Q8K4N3 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Defb12Q8K4N3 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Defb12Q8K4N3 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Defb12Q8K4N3 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Defb12Q8K4N3 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Defb12Q8K4N3 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Defb12Q8K4N3 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Defb12Q8K4N3 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Defb12Q8K4N3 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms