Protein–RNA interactions for Protein: Q8K259

Gin1, Gypsy retrotransposon integrase-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gin1Q8K259 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Gin1Q8K259 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Gin1Q8K259 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Gin1Q8K259 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Gin1Q8K259 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Gin1Q8K259 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Gin1Q8K259 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Gin1Q8K259 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Gin1Q8K259 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Gin1Q8K259 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Gin1Q8K259 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Gin1Q8K259 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Gin1Q8K259 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Gin1Q8K259 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Gin1Q8K259 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Gin1Q8K259 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Gin1Q8K259 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Gin1Q8K259 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Gin1Q8K259 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Gin1Q8K259 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Gin1Q8K259 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Gin1Q8K259 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Gin1Q8K259 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Gin1Q8K259 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Gin1Q8K259 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Gin1Q8K259 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Gin1Q8K259 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Gin1Q8K259 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Gin1Q8K259 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Gin1Q8K259 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Gin1Q8K259 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Gin1Q8K259 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Gin1Q8K259 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Gin1Q8K259 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gin1Q8K259 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gin1Q8K259 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gin1Q8K259 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gin1Q8K259 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Gin1Q8K259 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gin1Q8K259 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gin1Q8K259 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gin1Q8K259 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gin1Q8K259 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Gin1Q8K259 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gin1Q8K259 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gin1Q8K259 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Gin1Q8K259 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gin1Q8K259 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gin1Q8K259 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gin1Q8K259 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gin1Q8K259 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Gin1Q8K259 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gin1Q8K259 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gin1Q8K259 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gin1Q8K259 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
Gin1Q8K259 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gin1Q8K259 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gin1Q8K259 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gin1Q8K259 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gin1Q8K259 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gin1Q8K259 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gin1Q8K259 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gin1Q8K259 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gin1Q8K259 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gin1Q8K259 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gin1Q8K259 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gin1Q8K259 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gin1Q8K259 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gin1Q8K259 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gin1Q8K259 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gin1Q8K259 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gin1Q8K259 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gin1Q8K259 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gin1Q8K259 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gin1Q8K259 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gin1Q8K259 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gin1Q8K259 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gin1Q8K259 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Gin1Q8K259 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Gin1Q8K259 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Gin1Q8K259 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Gin1Q8K259 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gin1Q8K259 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gin1Q8K259 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gin1Q8K259 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gin1Q8K259 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gin1Q8K259 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gin1Q8K259 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gin1Q8K259 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gin1Q8K259 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gin1Q8K259 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gin1Q8K259 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gin1Q8K259 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gin1Q8K259 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gin1Q8K259 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gin1Q8K259 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gin1Q8K259 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gin1Q8K259 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gin1Q8K259 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gin1Q8K259 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75 ms