Protein–RNA interactions for Protein: Q8K243

Trim68, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM68, mousemouse

Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim68Q8K243 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Trim68Q8K243 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Trim68Q8K243 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Trim68Q8K243 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Trim68Q8K243 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Trim68Q8K243 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Trim68Q8K243 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Trim68Q8K243 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Trim68Q8K243 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Trim68Q8K243 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Trim68Q8K243 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Trim68Q8K243 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Trim68Q8K243 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Trim68Q8K243 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Trim68Q8K243 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Trim68Q8K243 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
Trim68Q8K243 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Trim68Q8K243 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Trim68Q8K243 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
Trim68Q8K243 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Trim68Q8K243 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Trim68Q8K243 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Trim68Q8K243 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Trim68Q8K243 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Trim68Q8K243 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Trim68Q8K243 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Trim68Q8K243 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Trim68Q8K243 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Trim68Q8K243 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Trim68Q8K243 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Trim68Q8K243 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Trim68Q8K243 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Trim68Q8K243 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Trim68Q8K243 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Trim68Q8K243 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Trim68Q8K243 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Trim68Q8K243 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Trim68Q8K243 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Trim68Q8K243 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Trim68Q8K243 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Trim68Q8K243 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Trim68Q8K243 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Trim68Q8K243 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Trim68Q8K243 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Trim68Q8K243 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
Trim68Q8K243 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
Trim68Q8K243 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Trim68Q8K243 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Trim68Q8K243 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Trim68Q8K243 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Trim68Q8K243 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Trim68Q8K243 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Trim68Q8K243 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Trim68Q8K243 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.05
Trim68Q8K243 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Trim68Q8K243 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Trim68Q8K243 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Trim68Q8K243 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Trim68Q8K243 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Trim68Q8K243 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
Trim68Q8K243 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Trim68Q8K243 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Trim68Q8K243 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Trim68Q8K243 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Trim68Q8K243 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Trim68Q8K243 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Trim68Q8K243 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Trim68Q8K243 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Trim68Q8K243 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Trim68Q8K243 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Trim68Q8K243 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Trim68Q8K243 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Trim68Q8K243 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Trim68Q8K243 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Trim68Q8K243 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
Trim68Q8K243 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Trim68Q8K243 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Trim68Q8K243 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Trim68Q8K243 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Trim68Q8K243 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Trim68Q8K243 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Trim68Q8K243 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Trim68Q8K243 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Trim68Q8K243 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Trim68Q8K243 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Trim68Q8K243 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Trim68Q8K243 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Trim68Q8K243 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Trim68Q8K243 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Trim68Q8K243 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Trim68Q8K243 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Trim68Q8K243 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Trim68Q8K243 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Trim68Q8K243 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Trim68Q8K243 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Trim68Q8K243 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Trim68Q8K243 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Trim68Q8K243 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Trim68Q8K243 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Trim68Q8K243 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
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