Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1S5

Klf11, Krueppel-like factor 11, mousemouse

Predictions only

Length 502 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf11Q8K1S5 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Klf11Q8K1S5 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Klf11Q8K1S5 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Klf11Q8K1S5 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Klf11Q8K1S5 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Klf11Q8K1S5 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Klf11Q8K1S5 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Klf11Q8K1S5 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Klf11Q8K1S5 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Klf11Q8K1S5 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Klf11Q8K1S5 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Klf11Q8K1S5 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Klf11Q8K1S5 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Klf11Q8K1S5 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Klf11Q8K1S5 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Klf11Q8K1S5 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Klf11Q8K1S5 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Klf11Q8K1S5 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Klf11Q8K1S5 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Klf11Q8K1S5 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Klf11Q8K1S5 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Klf11Q8K1S5 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Klf11Q8K1S5 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Klf11Q8K1S5 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Klf11Q8K1S5 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Klf11Q8K1S5 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Klf11Q8K1S5 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Klf11Q8K1S5 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Klf11Q8K1S5 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Klf11Q8K1S5 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Klf11Q8K1S5 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Klf11Q8K1S5 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Klf11Q8K1S5 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Klf11Q8K1S5 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Klf11Q8K1S5 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Klf11Q8K1S5 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Klf11Q8K1S5 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Klf11Q8K1S5 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Klf11Q8K1S5 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Klf11Q8K1S5 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Klf11Q8K1S5 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Klf11Q8K1S5 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Klf11Q8K1S5 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Klf11Q8K1S5 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Klf11Q8K1S5 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Klf11Q8K1S5 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Klf11Q8K1S5 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Klf11Q8K1S5 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Klf11Q8K1S5 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Klf11Q8K1S5 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Klf11Q8K1S5 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Klf11Q8K1S5 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Klf11Q8K1S5 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Klf11Q8K1S5 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Klf11Q8K1S5 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Klf11Q8K1S5 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Klf11Q8K1S5 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Klf11Q8K1S5 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Klf11Q8K1S5 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Klf11Q8K1S5 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Klf11Q8K1S5 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Klf11Q8K1S5 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Klf11Q8K1S5 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Klf11Q8K1S5 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Klf11Q8K1S5 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Klf11Q8K1S5 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Klf11Q8K1S5 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Klf11Q8K1S5 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Klf11Q8K1S5 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Klf11Q8K1S5 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Klf11Q8K1S5 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Klf11Q8K1S5 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Klf11Q8K1S5 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Klf11Q8K1S5 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Klf11Q8K1S5 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Klf11Q8K1S5 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Klf11Q8K1S5 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Klf11Q8K1S5 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Klf11Q8K1S5 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Klf11Q8K1S5 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Klf11Q8K1S5 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Klf11Q8K1S5 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23■■□□□ 1.27
Klf11Q8K1S5 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Klf11Q8K1S5 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Klf11Q8K1S5 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Klf11Q8K1S5 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Klf11Q8K1S5 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Klf11Q8K1S5 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Klf11Q8K1S5 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Klf11Q8K1S5 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Klf11Q8K1S5 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Klf11Q8K1S5 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Klf11Q8K1S5 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Klf11Q8K1S5 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Klf11Q8K1S5 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Klf11Q8K1S5 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Klf11Q8K1S5 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Klf11Q8K1S5 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Klf11Q8K1S5 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Klf11Q8K1S5 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms