Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0U4

Hspa12a, Heat shock 70 kDa protein 12A, mousemouse

Predictions only

Length 675 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hspa12aQ8K0U4 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Hspa12aQ8K0U4 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Hspa12aQ8K0U4 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Hspa12aQ8K0U4 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Hspa12aQ8K0U4 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Hspa12aQ8K0U4 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Hspa12aQ8K0U4 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Hspa12aQ8K0U4 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Hspa12aQ8K0U4 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Hspa12aQ8K0U4 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Hspa12aQ8K0U4 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Hspa12aQ8K0U4 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Hspa12aQ8K0U4 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Hspa12aQ8K0U4 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Hspa12aQ8K0U4 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Hspa12aQ8K0U4 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Hspa12aQ8K0U4 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Hspa12aQ8K0U4 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Hspa12aQ8K0U4 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Hspa12aQ8K0U4 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Hspa12aQ8K0U4 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Hspa12aQ8K0U4 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Hspa12aQ8K0U4 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Hspa12aQ8K0U4 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Hspa12aQ8K0U4 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Hspa12aQ8K0U4 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Hspa12aQ8K0U4 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Hspa12aQ8K0U4 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Hspa12aQ8K0U4 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Hspa12aQ8K0U4 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Hspa12aQ8K0U4 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Hspa12aQ8K0U4 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
Hspa12aQ8K0U4 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Hspa12aQ8K0U4 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hspa12aQ8K0U4 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hspa12aQ8K0U4 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hspa12aQ8K0U4 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Hspa12aQ8K0U4 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hspa12aQ8K0U4 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Hspa12aQ8K0U4 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hspa12aQ8K0U4 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hspa12aQ8K0U4 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hspa12aQ8K0U4 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Hspa12aQ8K0U4 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hspa12aQ8K0U4 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hspa12aQ8K0U4 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hspa12aQ8K0U4 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hspa12aQ8K0U4 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hspa12aQ8K0U4 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hspa12aQ8K0U4 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Hspa12aQ8K0U4 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hspa12aQ8K0U4 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hspa12aQ8K0U4 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hspa12aQ8K0U4 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hspa12aQ8K0U4 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Hspa12aQ8K0U4 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hspa12aQ8K0U4 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hspa12aQ8K0U4 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hspa12aQ8K0U4 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hspa12aQ8K0U4 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hspa12aQ8K0U4 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hspa12aQ8K0U4 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Hspa12aQ8K0U4 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Hspa12aQ8K0U4 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hspa12aQ8K0U4 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hspa12aQ8K0U4 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hspa12aQ8K0U4 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hspa12aQ8K0U4 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hspa12aQ8K0U4 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hspa12aQ8K0U4 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hspa12aQ8K0U4 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hspa12aQ8K0U4 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hspa12aQ8K0U4 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hspa12aQ8K0U4 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hspa12aQ8K0U4 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hspa12aQ8K0U4 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hspa12aQ8K0U4 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Hspa12aQ8K0U4 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Hspa12aQ8K0U4 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC21.32■■□□□ 1
Hspa12aQ8K0U4 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Hspa12aQ8K0U4 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Hspa12aQ8K0U4 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Hspa12aQ8K0U4 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Hspa12aQ8K0U4 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Hspa12aQ8K0U4 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Hspa12aQ8K0U4 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Hspa12aQ8K0U4 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Hspa12aQ8K0U4 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Hspa12aQ8K0U4 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Hspa12aQ8K0U4 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Hspa12aQ8K0U4 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hspa12aQ8K0U4 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hspa12aQ8K0U4 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hspa12aQ8K0U4 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Hspa12aQ8K0U4 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hspa12aQ8K0U4 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hspa12aQ8K0U4 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hspa12aQ8K0U4 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Hspa12aQ8K0U4 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Hspa12aQ8K0U4 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms