Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0E3

Slc5a11, Sodium/myo-inositol cotransporter 2, mousemouse

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Length 673 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc5a11Q8K0E3 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Slc5a11Q8K0E3 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Slc5a11Q8K0E3 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Slc5a11Q8K0E3 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Slc5a11Q8K0E3 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Slc5a11Q8K0E3 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Slc5a11Q8K0E3 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Slc5a11Q8K0E3 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Slc5a11Q8K0E3 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Slc5a11Q8K0E3 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Slc5a11Q8K0E3 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Slc5a11Q8K0E3 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Slc5a11Q8K0E3 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Slc5a11Q8K0E3 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Slc5a11Q8K0E3 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Slc5a11Q8K0E3 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Slc5a11Q8K0E3 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Slc5a11Q8K0E3 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
Slc5a11Q8K0E3 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Slc5a11Q8K0E3 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Slc5a11Q8K0E3 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Slc5a11Q8K0E3 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Slc5a11Q8K0E3 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Slc5a11Q8K0E3 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Slc5a11Q8K0E3 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Slc5a11Q8K0E3 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Slc5a11Q8K0E3 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Slc5a11Q8K0E3 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Slc5a11Q8K0E3 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Slc5a11Q8K0E3 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Slc5a11Q8K0E3 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Slc5a11Q8K0E3 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Slc5a11Q8K0E3 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Slc5a11Q8K0E3 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Slc5a11Q8K0E3 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Slc5a11Q8K0E3 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Slc5a11Q8K0E3 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Slc5a11Q8K0E3 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Slc5a11Q8K0E3 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Slc5a11Q8K0E3 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Slc5a11Q8K0E3 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Slc5a11Q8K0E3 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Slc5a11Q8K0E3 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Slc5a11Q8K0E3 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Slc5a11Q8K0E3 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Slc5a11Q8K0E3 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Slc5a11Q8K0E3 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Slc5a11Q8K0E3 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Slc5a11Q8K0E3 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Slc5a11Q8K0E3 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Slc5a11Q8K0E3 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Slc5a11Q8K0E3 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Slc5a11Q8K0E3 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Slc5a11Q8K0E3 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Slc5a11Q8K0E3 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Slc5a11Q8K0E3 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Slc5a11Q8K0E3 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Slc5a11Q8K0E3 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Slc5a11Q8K0E3 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Slc5a11Q8K0E3 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Slc5a11Q8K0E3 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Slc5a11Q8K0E3 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Slc5a11Q8K0E3 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Slc5a11Q8K0E3 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Slc5a11Q8K0E3 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Slc5a11Q8K0E3 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Slc5a11Q8K0E3 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Slc5a11Q8K0E3 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Slc5a11Q8K0E3 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Slc5a11Q8K0E3 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Slc5a11Q8K0E3 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Slc5a11Q8K0E3 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Slc5a11Q8K0E3 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Slc5a11Q8K0E3 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Slc5a11Q8K0E3 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Slc5a11Q8K0E3 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Slc5a11Q8K0E3 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Slc5a11Q8K0E3 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Slc5a11Q8K0E3 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Slc5a11Q8K0E3 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Slc5a11Q8K0E3 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Slc5a11Q8K0E3 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Slc5a11Q8K0E3 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Slc5a11Q8K0E3 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Slc5a11Q8K0E3 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Slc5a11Q8K0E3 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Slc5a11Q8K0E3 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Slc5a11Q8K0E3 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Slc5a11Q8K0E3 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Slc5a11Q8K0E3 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Slc5a11Q8K0E3 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Slc5a11Q8K0E3 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Slc5a11Q8K0E3 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Slc5a11Q8K0E3 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Slc5a11Q8K0E3 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Slc5a11Q8K0E3 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Slc5a11Q8K0E3 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Slc5a11Q8K0E3 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Slc5a11Q8K0E3 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Slc5a11Q8K0E3 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms