Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0D2

Habp2, Hyaluronan-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 558 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Habp2Q8K0D2 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Habp2Q8K0D2 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Habp2Q8K0D2 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Habp2Q8K0D2 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Habp2Q8K0D2 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Habp2Q8K0D2 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Habp2Q8K0D2 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Habp2Q8K0D2 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Habp2Q8K0D2 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Habp2Q8K0D2 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Habp2Q8K0D2 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Habp2Q8K0D2 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Habp2Q8K0D2 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Habp2Q8K0D2 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Habp2Q8K0D2 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Habp2Q8K0D2 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Habp2Q8K0D2 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Habp2Q8K0D2 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Habp2Q8K0D2 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Habp2Q8K0D2 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Habp2Q8K0D2 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Habp2Q8K0D2 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Habp2Q8K0D2 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Habp2Q8K0D2 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Habp2Q8K0D2 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Habp2Q8K0D2 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Habp2Q8K0D2 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Habp2Q8K0D2 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Habp2Q8K0D2 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Habp2Q8K0D2 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Habp2Q8K0D2 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Habp2Q8K0D2 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Habp2Q8K0D2 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Habp2Q8K0D2 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Habp2Q8K0D2 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Habp2Q8K0D2 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Habp2Q8K0D2 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Habp2Q8K0D2 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Habp2Q8K0D2 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Habp2Q8K0D2 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Habp2Q8K0D2 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Habp2Q8K0D2 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Habp2Q8K0D2 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Habp2Q8K0D2 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Habp2Q8K0D2 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Habp2Q8K0D2 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Habp2Q8K0D2 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Habp2Q8K0D2 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Habp2Q8K0D2 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Habp2Q8K0D2 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Habp2Q8K0D2 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Habp2Q8K0D2 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Habp2Q8K0D2 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Habp2Q8K0D2 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Habp2Q8K0D2 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Habp2Q8K0D2 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Habp2Q8K0D2 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Habp2Q8K0D2 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Habp2Q8K0D2 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Habp2Q8K0D2 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Habp2Q8K0D2 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Habp2Q8K0D2 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Habp2Q8K0D2 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Habp2Q8K0D2 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Habp2Q8K0D2 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Habp2Q8K0D2 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Habp2Q8K0D2 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Habp2Q8K0D2 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Habp2Q8K0D2 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Habp2Q8K0D2 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Habp2Q8K0D2 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Habp2Q8K0D2 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Habp2Q8K0D2 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Habp2Q8K0D2 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Habp2Q8K0D2 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Habp2Q8K0D2 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Habp2Q8K0D2 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Habp2Q8K0D2 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Habp2Q8K0D2 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Habp2Q8K0D2 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Habp2Q8K0D2 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Habp2Q8K0D2 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Habp2Q8K0D2 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Habp2Q8K0D2 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Habp2Q8K0D2 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Habp2Q8K0D2 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Habp2Q8K0D2 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Habp2Q8K0D2 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Habp2Q8K0D2 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Habp2Q8K0D2 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Habp2Q8K0D2 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Habp2Q8K0D2 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Habp2Q8K0D2 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Habp2Q8K0D2 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Habp2Q8K0D2 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Habp2Q8K0D2 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Habp2Q8K0D2 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Habp2Q8K0D2 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Habp2Q8K0D2 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Habp2Q8K0D2 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.8 ms