Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHC4

Synj1, Synaptojanin-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Synj1Q8CHC4 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC46.98■■■■■ 5.11
Synj1Q8CHC4 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.98■■■■■ 5.11
Synj1Q8CHC4 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC46.95■■■■■ 5.11
Synj1Q8CHC4 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC46.94■■■■■ 5.1
Synj1Q8CHC4 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC46.92■■■■■ 5.1
Synj1Q8CHC4 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC46.91■■■■■ 5.1
Synj1Q8CHC4 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC46.9■■■■■ 5.1
Synj1Q8CHC4 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC46.9■■■■■ 5.1
Synj1Q8CHC4 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC46.86■■■■■ 5.09
Synj1Q8CHC4 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC46.86■■■■■ 5.09
Synj1Q8CHC4 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC46.81■■■■■ 5.08
Synj1Q8CHC4 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC46.79■■■■■ 5.08
Synj1Q8CHC4 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC46.73■■■■■ 5.07
Synj1Q8CHC4 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC46.73■■■■■ 5.07
Synj1Q8CHC4 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC46.73■■■■■ 5.07
Synj1Q8CHC4 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.7■■■■■ 5.07
Synj1Q8CHC4 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.65■■■■■ 5.06
Synj1Q8CHC4 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC46.65■■■■■ 5.06
Synj1Q8CHC4 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC46.64■■■■■ 5.06
Synj1Q8CHC4 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.63■■■■■ 5.06
Synj1Q8CHC4 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC46.62■■■■■ 5.05
Synj1Q8CHC4 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC46.61■■■■■ 5.05
Synj1Q8CHC4 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC46.6■■■■■ 5.05
Synj1Q8CHC4 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC46.6■■■■■ 5.05
Synj1Q8CHC4 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.6■■■■■ 5.05
Synj1Q8CHC4 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC46.57■■■■■ 5.05
Synj1Q8CHC4 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC46.55■■■■■ 5.04
Synj1Q8CHC4 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC46.52■■■■■ 5.04
Synj1Q8CHC4 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.52■■■■■ 5.04
Synj1Q8CHC4 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC46.48■■■■■ 5.03
Synj1Q8CHC4 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.48■■■■■ 5.03
Synj1Q8CHC4 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC46.47■■■■■ 5.03
Synj1Q8CHC4 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.46■■■■■ 5.03
Synj1Q8CHC4 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.45■■■■■ 5.03
Synj1Q8CHC4 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.45■■■■■ 5.03
Synj1Q8CHC4 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.4■■■■■ 5.02
Synj1Q8CHC4 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC46.37■■■■■ 5.01
Synj1Q8CHC4 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC46.37■■■■■ 5.01
Synj1Q8CHC4 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.37■■■■■ 5.01
Synj1Q8CHC4 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC46.36■■■■■ 5.01
Synj1Q8CHC4 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC46.32■■■■■ 5.01
Synj1Q8CHC4 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.29■■■■■ 5
Synj1Q8CHC4 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.26■■■■■ 5
Synj1Q8CHC4 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.25■■■■■ 4.99
Synj1Q8CHC4 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC46.24■■■■■ 4.99
Synj1Q8CHC4 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC46.21■■■■■ 4.99
Synj1Q8CHC4 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.21■■■■■ 4.99
Synj1Q8CHC4 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.21■■■■■ 4.99
Synj1Q8CHC4 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC46.18■■■■■ 4.98
Synj1Q8CHC4 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC46.17■■■■■ 4.98
Synj1Q8CHC4 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.16■■■■■ 4.98
Synj1Q8CHC4 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC46.15■■■■■ 4.98
Synj1Q8CHC4 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC46.14■■■■■ 4.98
Synj1Q8CHC4 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC46.13■■■■■ 4.97
Synj1Q8CHC4 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC46.13■■■■■ 4.97
Synj1Q8CHC4 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.12■■■■■ 4.97
Synj1Q8CHC4 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC46.08■■■■■ 4.97
Synj1Q8CHC4 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC46.08■■■■■ 4.97
Synj1Q8CHC4 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC46.08■■■■■ 4.97
Synj1Q8CHC4 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC46.06■■■■■ 4.96
Synj1Q8CHC4 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC46.06■■■■■ 4.96
Synj1Q8CHC4 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.05■■■■■ 4.96
Synj1Q8CHC4 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.03■■■■■ 4.96
Synj1Q8CHC4 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.03■■■■■ 4.96
Synj1Q8CHC4 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.03■■■■■ 4.96
Synj1Q8CHC4 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC46.01■■■■■ 4.96
Synj1Q8CHC4 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC46■■■■■ 4.95
Synj1Q8CHC4 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.99■■■■■ 4.95
Synj1Q8CHC4 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC45.98■■■■■ 4.95
Synj1Q8CHC4 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC45.96■■■■■ 4.95
Synj1Q8CHC4 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.91■■■■■ 4.94
Synj1Q8CHC4 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC45.88■■■■■ 4.94
Synj1Q8CHC4 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC45.88■■■■■ 4.93
Synj1Q8CHC4 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC45.87■■■■■ 4.93
Synj1Q8CHC4 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC45.87■■■■■ 4.93
Synj1Q8CHC4 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.78■■■■■ 4.92
Synj1Q8CHC4 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC45.78■■■■■ 4.92
Synj1Q8CHC4 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.74■■■■■ 4.91
Synj1Q8CHC4 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC45.73■■■■■ 4.91
Synj1Q8CHC4 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.73■■■■■ 4.91
Synj1Q8CHC4 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC45.71■■■■■ 4.91
Synj1Q8CHC4 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC45.7■■■■■ 4.91
Synj1Q8CHC4 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC45.67■■■■■ 4.9
Synj1Q8CHC4 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC45.62■■■■■ 4.89
Synj1Q8CHC4 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.6■■■■■ 4.89
Synj1Q8CHC4 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.59■■■■■ 4.89
Synj1Q8CHC4 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC45.58■■■■■ 4.89
Synj1Q8CHC4 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC45.58■■■■■ 4.89
Synj1Q8CHC4 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC45.58■■■■■ 4.89
Synj1Q8CHC4 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC45.56■■■■■ 4.88
Synj1Q8CHC4 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.56■■■■■ 4.88
Synj1Q8CHC4 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC45.54■■■■■ 4.88
Synj1Q8CHC4 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.51■■■■■ 4.88
Synj1Q8CHC4 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.51■■■■■ 4.88
Synj1Q8CHC4 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.5■■■■■ 4.87
Synj1Q8CHC4 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.49■■■■■ 4.87
Synj1Q8CHC4 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.46■■■■■ 4.87
Synj1Q8CHC4 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC45.45■■■■■ 4.87
Synj1Q8CHC4 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC45.45■■■■■ 4.87
Synj1Q8CHC4 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC45.44■■■■■ 4.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms