Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFI0

Nedd4l, E3 ubiquitin-protein ligase NEDD4-like, mousemouse

Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd4lQ8CFI0 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nedd4lQ8CFI0 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nedd4lQ8CFI0 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nedd4lQ8CFI0 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nedd4lQ8CFI0 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Nedd4lQ8CFI0 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nedd4lQ8CFI0 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nedd4lQ8CFI0 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nedd4lQ8CFI0 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nedd4lQ8CFI0 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Nedd4lQ8CFI0 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Nedd4lQ8CFI0 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nedd4lQ8CFI0 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nedd4lQ8CFI0 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nedd4lQ8CFI0 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Nedd4lQ8CFI0 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nedd4lQ8CFI0 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nedd4lQ8CFI0 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nedd4lQ8CFI0 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nedd4lQ8CFI0 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nedd4lQ8CFI0 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nedd4lQ8CFI0 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nedd4lQ8CFI0 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Nedd4lQ8CFI0 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Nedd4lQ8CFI0 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nedd4lQ8CFI0 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nedd4lQ8CFI0 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nedd4lQ8CFI0 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nedd4lQ8CFI0 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Nedd4lQ8CFI0 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nedd4lQ8CFI0 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nedd4lQ8CFI0 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nedd4lQ8CFI0 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nedd4lQ8CFI0 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nedd4lQ8CFI0 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nedd4lQ8CFI0 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nedd4lQ8CFI0 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nedd4lQ8CFI0 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nedd4lQ8CFI0 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nedd4lQ8CFI0 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nedd4lQ8CFI0 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nedd4lQ8CFI0 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Nedd4lQ8CFI0 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Nedd4lQ8CFI0 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nedd4lQ8CFI0 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nedd4lQ8CFI0 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nedd4lQ8CFI0 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nedd4lQ8CFI0 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nedd4lQ8CFI0 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nedd4lQ8CFI0 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nedd4lQ8CFI0 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nedd4lQ8CFI0 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nedd4lQ8CFI0 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nedd4lQ8CFI0 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nedd4lQ8CFI0 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Nedd4lQ8CFI0 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nedd4lQ8CFI0 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nedd4lQ8CFI0 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nedd4lQ8CFI0 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nedd4lQ8CFI0 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nedd4lQ8CFI0 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nedd4lQ8CFI0 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nedd4lQ8CFI0 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nedd4lQ8CFI0 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Nedd4lQ8CFI0 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nedd4lQ8CFI0 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nedd4lQ8CFI0 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Nedd4lQ8CFI0 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nedd4lQ8CFI0 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nedd4lQ8CFI0 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nedd4lQ8CFI0 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nedd4lQ8CFI0 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nedd4lQ8CFI0 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nedd4lQ8CFI0 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nedd4lQ8CFI0 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nedd4lQ8CFI0 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nedd4lQ8CFI0 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nedd4lQ8CFI0 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nedd4lQ8CFI0 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nedd4lQ8CFI0 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nedd4lQ8CFI0 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nedd4lQ8CFI0 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Nedd4lQ8CFI0 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nedd4lQ8CFI0 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nedd4lQ8CFI0 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nedd4lQ8CFI0 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Nedd4lQ8CFI0 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nedd4lQ8CFI0 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nedd4lQ8CFI0 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nedd4lQ8CFI0 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nedd4lQ8CFI0 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nedd4lQ8CFI0 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nedd4lQ8CFI0 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nedd4lQ8CFI0 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nedd4lQ8CFI0 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nedd4lQ8CFI0 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nedd4lQ8CFI0 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nedd4lQ8CFI0 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nedd4lQ8CFI0 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nedd4lQ8CFI0 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms