Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEJ8

Gm9955, Predicted gene 9955 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm9955Q8CEJ8 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm9955Q8CEJ8 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm9955Q8CEJ8 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm9955Q8CEJ8 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm9955Q8CEJ8 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm9955Q8CEJ8 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm9955Q8CEJ8 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm9955Q8CEJ8 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm9955Q8CEJ8 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm9955Q8CEJ8 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm9955Q8CEJ8 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm9955Q8CEJ8 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm9955Q8CEJ8 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm9955Q8CEJ8 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm9955Q8CEJ8 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm9955Q8CEJ8 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm9955Q8CEJ8 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm9955Q8CEJ8 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm9955Q8CEJ8 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm9955Q8CEJ8 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm9955Q8CEJ8 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm9955Q8CEJ8 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm9955Q8CEJ8 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm9955Q8CEJ8 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm9955Q8CEJ8 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm9955Q8CEJ8 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm9955Q8CEJ8 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm9955Q8CEJ8 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm9955Q8CEJ8 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm9955Q8CEJ8 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm9955Q8CEJ8 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm9955Q8CEJ8 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm9955Q8CEJ8 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm9955Q8CEJ8 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm9955Q8CEJ8 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm9955Q8CEJ8 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm9955Q8CEJ8 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm9955Q8CEJ8 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm9955Q8CEJ8 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm9955Q8CEJ8 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm9955Q8CEJ8 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm9955Q8CEJ8 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm9955Q8CEJ8 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm9955Q8CEJ8 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm9955Q8CEJ8 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm9955Q8CEJ8 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm9955Q8CEJ8 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm9955Q8CEJ8 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm9955Q8CEJ8 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm9955Q8CEJ8 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm9955Q8CEJ8 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm9955Q8CEJ8 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm9955Q8CEJ8 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm9955Q8CEJ8 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm9955Q8CEJ8 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm9955Q8CEJ8 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm9955Q8CEJ8 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm9955Q8CEJ8 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm9955Q8CEJ8 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm9955Q8CEJ8 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm9955Q8CEJ8 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm9955Q8CEJ8 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm9955Q8CEJ8 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm9955Q8CEJ8 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm9955Q8CEJ8 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm9955Q8CEJ8 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm9955Q8CEJ8 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm9955Q8CEJ8 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm9955Q8CEJ8 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm9955Q8CEJ8 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm9955Q8CEJ8 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm9955Q8CEJ8 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm9955Q8CEJ8 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm9955Q8CEJ8 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm9955Q8CEJ8 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm9955Q8CEJ8 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm9955Q8CEJ8 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm9955Q8CEJ8 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm9955Q8CEJ8 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm9955Q8CEJ8 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm9955Q8CEJ8 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Gm9955Q8CEJ8 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm9955Q8CEJ8 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm9955Q8CEJ8 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm9955Q8CEJ8 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm9955Q8CEJ8 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm9955Q8CEJ8 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm9955Q8CEJ8 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm9955Q8CEJ8 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm9955Q8CEJ8 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm9955Q8CEJ8 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm9955Q8CEJ8 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm9955Q8CEJ8 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm9955Q8CEJ8 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm9955Q8CEJ8 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm9955Q8CEJ8 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm9955Q8CEJ8 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm9955Q8CEJ8 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm9955Q8CEJ8 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm9955Q8CEJ8 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms