Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6I2

Sdhaf2, Succinate dehydrogenase assembly factor 2, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdhaf2Q8C6I2 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sdhaf2Q8C6I2 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sdhaf2Q8C6I2 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sdhaf2Q8C6I2 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sdhaf2Q8C6I2 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sdhaf2Q8C6I2 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sdhaf2Q8C6I2 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sdhaf2Q8C6I2 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sdhaf2Q8C6I2 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Sdhaf2Q8C6I2 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sdhaf2Q8C6I2 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sdhaf2Q8C6I2 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sdhaf2Q8C6I2 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sdhaf2Q8C6I2 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sdhaf2Q8C6I2 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sdhaf2Q8C6I2 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sdhaf2Q8C6I2 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sdhaf2Q8C6I2 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sdhaf2Q8C6I2 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sdhaf2Q8C6I2 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sdhaf2Q8C6I2 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sdhaf2Q8C6I2 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sdhaf2Q8C6I2 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sdhaf2Q8C6I2 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Sdhaf2Q8C6I2 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sdhaf2Q8C6I2 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sdhaf2Q8C6I2 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sdhaf2Q8C6I2 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sdhaf2Q8C6I2 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sdhaf2Q8C6I2 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sdhaf2Q8C6I2 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sdhaf2Q8C6I2 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sdhaf2Q8C6I2 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sdhaf2Q8C6I2 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sdhaf2Q8C6I2 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sdhaf2Q8C6I2 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sdhaf2Q8C6I2 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sdhaf2Q8C6I2 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sdhaf2Q8C6I2 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sdhaf2Q8C6I2 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sdhaf2Q8C6I2 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Sdhaf2Q8C6I2 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sdhaf2Q8C6I2 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sdhaf2Q8C6I2 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sdhaf2Q8C6I2 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Sdhaf2Q8C6I2 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sdhaf2Q8C6I2 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sdhaf2Q8C6I2 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sdhaf2Q8C6I2 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sdhaf2Q8C6I2 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sdhaf2Q8C6I2 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sdhaf2Q8C6I2 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sdhaf2Q8C6I2 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sdhaf2Q8C6I2 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sdhaf2Q8C6I2 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sdhaf2Q8C6I2 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Sdhaf2Q8C6I2 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sdhaf2Q8C6I2 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sdhaf2Q8C6I2 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sdhaf2Q8C6I2 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sdhaf2Q8C6I2 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sdhaf2Q8C6I2 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sdhaf2Q8C6I2 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sdhaf2Q8C6I2 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sdhaf2Q8C6I2 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sdhaf2Q8C6I2 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sdhaf2Q8C6I2 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sdhaf2Q8C6I2 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Sdhaf2Q8C6I2 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sdhaf2Q8C6I2 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sdhaf2Q8C6I2 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sdhaf2Q8C6I2 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sdhaf2Q8C6I2 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sdhaf2Q8C6I2 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Sdhaf2Q8C6I2 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sdhaf2Q8C6I2 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sdhaf2Q8C6I2 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sdhaf2Q8C6I2 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sdhaf2Q8C6I2 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sdhaf2Q8C6I2 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Sdhaf2Q8C6I2 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sdhaf2Q8C6I2 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sdhaf2Q8C6I2 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sdhaf2Q8C6I2 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sdhaf2Q8C6I2 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Sdhaf2Q8C6I2 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sdhaf2Q8C6I2 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sdhaf2Q8C6I2 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sdhaf2Q8C6I2 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sdhaf2Q8C6I2 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sdhaf2Q8C6I2 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sdhaf2Q8C6I2 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sdhaf2Q8C6I2 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sdhaf2Q8C6I2 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sdhaf2Q8C6I2 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sdhaf2Q8C6I2 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sdhaf2Q8C6I2 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sdhaf2Q8C6I2 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Sdhaf2Q8C6I2 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Sdhaf2Q8C6I2 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.6 ms