Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5W0

Clmn, Calmin, mousemouse

Predictions only

Length 1,052 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClmnQ8C5W0 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
ClmnQ8C5W0 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
ClmnQ8C5W0 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
ClmnQ8C5W0 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
ClmnQ8C5W0 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
ClmnQ8C5W0 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
ClmnQ8C5W0 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC28.92■■■□□ 2.22
ClmnQ8C5W0 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
ClmnQ8C5W0 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
ClmnQ8C5W0 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
ClmnQ8C5W0 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
ClmnQ8C5W0 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
ClmnQ8C5W0 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
ClmnQ8C5W0 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
ClmnQ8C5W0 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
ClmnQ8C5W0 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
ClmnQ8C5W0 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
ClmnQ8C5W0 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
ClmnQ8C5W0 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
ClmnQ8C5W0 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
ClmnQ8C5W0 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
ClmnQ8C5W0 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
ClmnQ8C5W0 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
ClmnQ8C5W0 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
ClmnQ8C5W0 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
ClmnQ8C5W0 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
ClmnQ8C5W0 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
ClmnQ8C5W0 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
ClmnQ8C5W0 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
ClmnQ8C5W0 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
ClmnQ8C5W0 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
ClmnQ8C5W0 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
ClmnQ8C5W0 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
ClmnQ8C5W0 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
ClmnQ8C5W0 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
ClmnQ8C5W0 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
ClmnQ8C5W0 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
ClmnQ8C5W0 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
ClmnQ8C5W0 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
ClmnQ8C5W0 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
ClmnQ8C5W0 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
ClmnQ8C5W0 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
ClmnQ8C5W0 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
ClmnQ8C5W0 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
ClmnQ8C5W0 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
ClmnQ8C5W0 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
ClmnQ8C5W0 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
ClmnQ8C5W0 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
ClmnQ8C5W0 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
ClmnQ8C5W0 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
ClmnQ8C5W0 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
ClmnQ8C5W0 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
ClmnQ8C5W0 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
ClmnQ8C5W0 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
ClmnQ8C5W0 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
ClmnQ8C5W0 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
ClmnQ8C5W0 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
ClmnQ8C5W0 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
ClmnQ8C5W0 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
ClmnQ8C5W0 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ClmnQ8C5W0 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ClmnQ8C5W0 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
ClmnQ8C5W0 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ClmnQ8C5W0 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
ClmnQ8C5W0 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
ClmnQ8C5W0 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ClmnQ8C5W0 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ClmnQ8C5W0 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ClmnQ8C5W0 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ClmnQ8C5W0 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
ClmnQ8C5W0 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ClmnQ8C5W0 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ClmnQ8C5W0 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
ClmnQ8C5W0 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ClmnQ8C5W0 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ClmnQ8C5W0 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ClmnQ8C5W0 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ClmnQ8C5W0 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
ClmnQ8C5W0 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
ClmnQ8C5W0 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
ClmnQ8C5W0 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ClmnQ8C5W0 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ClmnQ8C5W0 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ClmnQ8C5W0 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
ClmnQ8C5W0 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ClmnQ8C5W0 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
ClmnQ8C5W0 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC28.17■■■□□ 2.1
ClmnQ8C5W0 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
ClmnQ8C5W0 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
ClmnQ8C5W0 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
ClmnQ8C5W0 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
ClmnQ8C5W0 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
ClmnQ8C5W0 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
ClmnQ8C5W0 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ClmnQ8C5W0 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ClmnQ8C5W0 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ClmnQ8C5W0 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ClmnQ8C5W0 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ClmnQ8C5W0 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ClmnQ8C5W0 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.1 ms