Protein–RNA interactions for Protein: Q8C3B8

Rft1, Protein RFT1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rft1Q8C3B8 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rft1Q8C3B8 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rft1Q8C3B8 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rft1Q8C3B8 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rft1Q8C3B8 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Rft1Q8C3B8 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Rft1Q8C3B8 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rft1Q8C3B8 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rft1Q8C3B8 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rft1Q8C3B8 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rft1Q8C3B8 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Rft1Q8C3B8 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rft1Q8C3B8 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rft1Q8C3B8 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rft1Q8C3B8 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rft1Q8C3B8 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rft1Q8C3B8 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rft1Q8C3B8 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Rft1Q8C3B8 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rft1Q8C3B8 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rft1Q8C3B8 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rft1Q8C3B8 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rft1Q8C3B8 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rft1Q8C3B8 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rft1Q8C3B8 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rft1Q8C3B8 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rft1Q8C3B8 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rft1Q8C3B8 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rft1Q8C3B8 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rft1Q8C3B8 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rft1Q8C3B8 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rft1Q8C3B8 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rft1Q8C3B8 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Rft1Q8C3B8 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rft1Q8C3B8 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rft1Q8C3B8 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rft1Q8C3B8 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rft1Q8C3B8 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rft1Q8C3B8 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Rft1Q8C3B8 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rft1Q8C3B8 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Rft1Q8C3B8 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rft1Q8C3B8 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rft1Q8C3B8 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rft1Q8C3B8 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rft1Q8C3B8 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rft1Q8C3B8 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rft1Q8C3B8 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rft1Q8C3B8 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rft1Q8C3B8 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Rft1Q8C3B8 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rft1Q8C3B8 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rft1Q8C3B8 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Rft1Q8C3B8 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rft1Q8C3B8 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rft1Q8C3B8 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rft1Q8C3B8 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rft1Q8C3B8 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rft1Q8C3B8 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rft1Q8C3B8 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rft1Q8C3B8 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rft1Q8C3B8 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rft1Q8C3B8 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rft1Q8C3B8 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rft1Q8C3B8 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rft1Q8C3B8 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Rft1Q8C3B8 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Rft1Q8C3B8 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Rft1Q8C3B8 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rft1Q8C3B8 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rft1Q8C3B8 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rft1Q8C3B8 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rft1Q8C3B8 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rft1Q8C3B8 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rft1Q8C3B8 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rft1Q8C3B8 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rft1Q8C3B8 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rft1Q8C3B8 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rft1Q8C3B8 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rft1Q8C3B8 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rft1Q8C3B8 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rft1Q8C3B8 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rft1Q8C3B8 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rft1Q8C3B8 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rft1Q8C3B8 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rft1Q8C3B8 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rft1Q8C3B8 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rft1Q8C3B8 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rft1Q8C3B8 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Rft1Q8C3B8 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Rft1Q8C3B8 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rft1Q8C3B8 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rft1Q8C3B8 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rft1Q8C3B8 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rft1Q8C3B8 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rft1Q8C3B8 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rft1Q8C3B8 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rft1Q8C3B8 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rft1Q8C3B8 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rft1Q8C3B8 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms