Protein–RNA interactions for Protein: Q8C263

Ska3, Spindle and kinetochore-associated protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ska3Q8C263 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ska3Q8C263 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ska3Q8C263 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ska3Q8C263 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ska3Q8C263 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ska3Q8C263 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ska3Q8C263 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ska3Q8C263 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ska3Q8C263 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ska3Q8C263 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Ska3Q8C263 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ska3Q8C263 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ska3Q8C263 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ska3Q8C263 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ska3Q8C263 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ska3Q8C263 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ska3Q8C263 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ska3Q8C263 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ska3Q8C263 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ska3Q8C263 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ska3Q8C263 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ska3Q8C263 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ska3Q8C263 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
Ska3Q8C263 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ska3Q8C263 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ska3Q8C263 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ska3Q8C263 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ska3Q8C263 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ska3Q8C263 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ska3Q8C263 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ska3Q8C263 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ska3Q8C263 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ska3Q8C263 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ska3Q8C263 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ska3Q8C263 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Ska3Q8C263 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ska3Q8C263 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ska3Q8C263 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ska3Q8C263 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ska3Q8C263 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ska3Q8C263 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ska3Q8C263 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ska3Q8C263 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ska3Q8C263 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ska3Q8C263 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Ska3Q8C263 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ska3Q8C263 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ska3Q8C263 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ska3Q8C263 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ska3Q8C263 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ska3Q8C263 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ska3Q8C263 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ska3Q8C263 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ska3Q8C263 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ska3Q8C263 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ska3Q8C263 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ska3Q8C263 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ska3Q8C263 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ska3Q8C263 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ska3Q8C263 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ska3Q8C263 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ska3Q8C263 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ska3Q8C263 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ska3Q8C263 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ska3Q8C263 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Ska3Q8C263 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ska3Q8C263 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ska3Q8C263 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Ska3Q8C263 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ska3Q8C263 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ska3Q8C263 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ska3Q8C263 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ska3Q8C263 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ska3Q8C263 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ska3Q8C263 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ska3Q8C263 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ska3Q8C263 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ska3Q8C263 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ska3Q8C263 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ska3Q8C263 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ska3Q8C263 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ska3Q8C263 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ska3Q8C263 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ska3Q8C263 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ska3Q8C263 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ska3Q8C263 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Ska3Q8C263 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ska3Q8C263 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ska3Q8C263 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ska3Q8C263 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ska3Q8C263 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ska3Q8C263 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ska3Q8C263 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ska3Q8C263 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ska3Q8C263 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ska3Q8C263 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ska3Q8C263 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ska3Q8C263 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Ska3Q8C263 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ska3Q8C263 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87 ms