Protein–RNA interactions for Protein: Q8BZM0

Klhl12, Kelch-like protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 568 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl12Q8BZM0 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Klhl12Q8BZM0 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Klhl12Q8BZM0 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Klhl12Q8BZM0 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Klhl12Q8BZM0 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Klhl12Q8BZM0 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Klhl12Q8BZM0 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Klhl12Q8BZM0 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Klhl12Q8BZM0 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Klhl12Q8BZM0 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Klhl12Q8BZM0 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Klhl12Q8BZM0 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Klhl12Q8BZM0 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Klhl12Q8BZM0 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Klhl12Q8BZM0 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Klhl12Q8BZM0 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Klhl12Q8BZM0 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Klhl12Q8BZM0 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Klhl12Q8BZM0 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Klhl12Q8BZM0 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Klhl12Q8BZM0 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Klhl12Q8BZM0 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Klhl12Q8BZM0 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Klhl12Q8BZM0 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Klhl12Q8BZM0 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Klhl12Q8BZM0 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Klhl12Q8BZM0 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Klhl12Q8BZM0 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Klhl12Q8BZM0 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Klhl12Q8BZM0 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Klhl12Q8BZM0 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Klhl12Q8BZM0 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Klhl12Q8BZM0 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Klhl12Q8BZM0 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Klhl12Q8BZM0 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Klhl12Q8BZM0 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Klhl12Q8BZM0 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Klhl12Q8BZM0 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Klhl12Q8BZM0 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Klhl12Q8BZM0 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Klhl12Q8BZM0 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Klhl12Q8BZM0 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Klhl12Q8BZM0 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Klhl12Q8BZM0 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Klhl12Q8BZM0 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Klhl12Q8BZM0 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Klhl12Q8BZM0 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Klhl12Q8BZM0 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Klhl12Q8BZM0 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Klhl12Q8BZM0 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Klhl12Q8BZM0 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Klhl12Q8BZM0 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Klhl12Q8BZM0 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Klhl12Q8BZM0 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Klhl12Q8BZM0 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Klhl12Q8BZM0 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Klhl12Q8BZM0 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Klhl12Q8BZM0 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Klhl12Q8BZM0 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Klhl12Q8BZM0 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Klhl12Q8BZM0 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Klhl12Q8BZM0 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Klhl12Q8BZM0 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Klhl12Q8BZM0 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Klhl12Q8BZM0 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Klhl12Q8BZM0 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Klhl12Q8BZM0 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Klhl12Q8BZM0 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Klhl12Q8BZM0 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Klhl12Q8BZM0 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Klhl12Q8BZM0 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Klhl12Q8BZM0 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Klhl12Q8BZM0 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Klhl12Q8BZM0 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Klhl12Q8BZM0 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Klhl12Q8BZM0 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Klhl12Q8BZM0 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Klhl12Q8BZM0 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Klhl12Q8BZM0 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Klhl12Q8BZM0 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Klhl12Q8BZM0 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Klhl12Q8BZM0 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Klhl12Q8BZM0 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Klhl12Q8BZM0 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Klhl12Q8BZM0 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Klhl12Q8BZM0 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Klhl12Q8BZM0 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Klhl12Q8BZM0 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Klhl12Q8BZM0 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Klhl12Q8BZM0 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Klhl12Q8BZM0 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Klhl12Q8BZM0 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Klhl12Q8BZM0 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Klhl12Q8BZM0 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Klhl12Q8BZM0 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Klhl12Q8BZM0 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Klhl12Q8BZM0 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Klhl12Q8BZM0 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Klhl12Q8BZM0 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Klhl12Q8BZM0 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms