Protein–RNA interactions for Protein: Q8BYK4

Rdh12, Retinol dehydrogenase 12, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh12Q8BYK4 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rdh12Q8BYK4 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rdh12Q8BYK4 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rdh12Q8BYK4 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rdh12Q8BYK4 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Rdh12Q8BYK4 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Rdh12Q8BYK4 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Rdh12Q8BYK4 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rdh12Q8BYK4 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rdh12Q8BYK4 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rdh12Q8BYK4 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rdh12Q8BYK4 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Rdh12Q8BYK4 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Rdh12Q8BYK4 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Rdh12Q8BYK4 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Rdh12Q8BYK4 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rdh12Q8BYK4 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Rdh12Q8BYK4 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rdh12Q8BYK4 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rdh12Q8BYK4 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rdh12Q8BYK4 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rdh12Q8BYK4 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Rdh12Q8BYK4 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rdh12Q8BYK4 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rdh12Q8BYK4 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rdh12Q8BYK4 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rdh12Q8BYK4 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rdh12Q8BYK4 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rdh12Q8BYK4 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rdh12Q8BYK4 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rdh12Q8BYK4 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rdh12Q8BYK4 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rdh12Q8BYK4 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rdh12Q8BYK4 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rdh12Q8BYK4 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rdh12Q8BYK4 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Rdh12Q8BYK4 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Rdh12Q8BYK4 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rdh12Q8BYK4 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rdh12Q8BYK4 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rdh12Q8BYK4 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rdh12Q8BYK4 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Rdh12Q8BYK4 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rdh12Q8BYK4 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Rdh12Q8BYK4 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rdh12Q8BYK4 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rdh12Q8BYK4 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rdh12Q8BYK4 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rdh12Q8BYK4 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rdh12Q8BYK4 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rdh12Q8BYK4 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rdh12Q8BYK4 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rdh12Q8BYK4 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rdh12Q8BYK4 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rdh12Q8BYK4 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rdh12Q8BYK4 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rdh12Q8BYK4 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rdh12Q8BYK4 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rdh12Q8BYK4 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rdh12Q8BYK4 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rdh12Q8BYK4 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rdh12Q8BYK4 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rdh12Q8BYK4 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rdh12Q8BYK4 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Rdh12Q8BYK4 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rdh12Q8BYK4 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rdh12Q8BYK4 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rdh12Q8BYK4 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rdh12Q8BYK4 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rdh12Q8BYK4 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rdh12Q8BYK4 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rdh12Q8BYK4 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rdh12Q8BYK4 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rdh12Q8BYK4 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rdh12Q8BYK4 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rdh12Q8BYK4 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rdh12Q8BYK4 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rdh12Q8BYK4 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rdh12Q8BYK4 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Rdh12Q8BYK4 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Rdh12Q8BYK4 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rdh12Q8BYK4 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rdh12Q8BYK4 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Rdh12Q8BYK4 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rdh12Q8BYK4 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rdh12Q8BYK4 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rdh12Q8BYK4 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rdh12Q8BYK4 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rdh12Q8BYK4 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rdh12Q8BYK4 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rdh12Q8BYK4 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rdh12Q8BYK4 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rdh12Q8BYK4 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Rdh12Q8BYK4 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Rdh12Q8BYK4 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rdh12Q8BYK4 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rdh12Q8BYK4 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rdh12Q8BYK4 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rdh12Q8BYK4 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Rdh12Q8BYK4 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms