Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXS2

Tnfsfm13, Tumor necrosis factor (ligand) superfamily, membrane-bound member 13, mousemouse

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsfm13Q8BXS2 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tnfsfm13Q8BXS2 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Tnfsfm13Q8BXS2 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tnfsfm13Q8BXS2 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tnfsfm13Q8BXS2 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tnfsfm13Q8BXS2 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Tnfsfm13Q8BXS2 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tnfsfm13Q8BXS2 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tnfsfm13Q8BXS2 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tnfsfm13Q8BXS2 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Tnfsfm13Q8BXS2 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tnfsfm13Q8BXS2 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tnfsfm13Q8BXS2 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tnfsfm13Q8BXS2 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tnfsfm13Q8BXS2 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Tnfsfm13Q8BXS2 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tnfsfm13Q8BXS2 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Tnfsfm13Q8BXS2 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tnfsfm13Q8BXS2 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tnfsfm13Q8BXS2 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tnfsfm13Q8BXS2 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tnfsfm13Q8BXS2 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tnfsfm13Q8BXS2 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Tnfsfm13Q8BXS2 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tnfsfm13Q8BXS2 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Tnfsfm13Q8BXS2 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tnfsfm13Q8BXS2 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tnfsfm13Q8BXS2 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tnfsfm13Q8BXS2 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tnfsfm13Q8BXS2 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tnfsfm13Q8BXS2 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tnfsfm13Q8BXS2 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tnfsfm13Q8BXS2 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tnfsfm13Q8BXS2 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tnfsfm13Q8BXS2 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tnfsfm13Q8BXS2 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Tnfsfm13Q8BXS2 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tnfsfm13Q8BXS2 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tnfsfm13Q8BXS2 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tnfsfm13Q8BXS2 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tnfsfm13Q8BXS2 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tnfsfm13Q8BXS2 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tnfsfm13Q8BXS2 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tnfsfm13Q8BXS2 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tnfsfm13Q8BXS2 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tnfsfm13Q8BXS2 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tnfsfm13Q8BXS2 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tnfsfm13Q8BXS2 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tnfsfm13Q8BXS2 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tnfsfm13Q8BXS2 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Tnfsfm13Q8BXS2 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tnfsfm13Q8BXS2 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tnfsfm13Q8BXS2 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tnfsfm13Q8BXS2 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tnfsfm13Q8BXS2 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tnfsfm13Q8BXS2 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tnfsfm13Q8BXS2 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tnfsfm13Q8BXS2 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tnfsfm13Q8BXS2 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tnfsfm13Q8BXS2 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Tnfsfm13Q8BXS2 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tnfsfm13Q8BXS2 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tnfsfm13Q8BXS2 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tnfsfm13Q8BXS2 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tnfsfm13Q8BXS2 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tnfsfm13Q8BXS2 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tnfsfm13Q8BXS2 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tnfsfm13Q8BXS2 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tnfsfm13Q8BXS2 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tnfsfm13Q8BXS2 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tnfsfm13Q8BXS2 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tnfsfm13Q8BXS2 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tnfsfm13Q8BXS2 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tnfsfm13Q8BXS2 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tnfsfm13Q8BXS2 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tnfsfm13Q8BXS2 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tnfsfm13Q8BXS2 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tnfsfm13Q8BXS2 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tnfsfm13Q8BXS2 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Tnfsfm13Q8BXS2 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Tnfsfm13Q8BXS2 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tnfsfm13Q8BXS2 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tnfsfm13Q8BXS2 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tnfsfm13Q8BXS2 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tnfsfm13Q8BXS2 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tnfsfm13Q8BXS2 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tnfsfm13Q8BXS2 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tnfsfm13Q8BXS2 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tnfsfm13Q8BXS2 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Tnfsfm13Q8BXS2 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tnfsfm13Q8BXS2 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tnfsfm13Q8BXS2 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.7 ms