Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXJ2

Trerf1, Transcriptional-regulating factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,205 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trerf1Q8BXJ2 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Trerf1Q8BXJ2 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Trerf1Q8BXJ2 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Trerf1Q8BXJ2 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Trerf1Q8BXJ2 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Trerf1Q8BXJ2 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Trerf1Q8BXJ2 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
Trerf1Q8BXJ2 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Trerf1Q8BXJ2 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Trerf1Q8BXJ2 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Trerf1Q8BXJ2 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Trerf1Q8BXJ2 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Trerf1Q8BXJ2 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Trerf1Q8BXJ2 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Trerf1Q8BXJ2 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Trerf1Q8BXJ2 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Trerf1Q8BXJ2 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Trerf1Q8BXJ2 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Trerf1Q8BXJ2 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Trerf1Q8BXJ2 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Trerf1Q8BXJ2 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Trerf1Q8BXJ2 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Trerf1Q8BXJ2 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Trerf1Q8BXJ2 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Trerf1Q8BXJ2 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Trerf1Q8BXJ2 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Trerf1Q8BXJ2 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Trerf1Q8BXJ2 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Trerf1Q8BXJ2 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.87
Trerf1Q8BXJ2 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Trerf1Q8BXJ2 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Trerf1Q8BXJ2 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Trerf1Q8BXJ2 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Trerf1Q8BXJ2 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Trerf1Q8BXJ2 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Trerf1Q8BXJ2 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
Trerf1Q8BXJ2 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
Trerf1Q8BXJ2 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Trerf1Q8BXJ2 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Trerf1Q8BXJ2 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Trerf1Q8BXJ2 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Trerf1Q8BXJ2 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Trerf1Q8BXJ2 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Trerf1Q8BXJ2 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Trerf1Q8BXJ2 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Trerf1Q8BXJ2 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Trerf1Q8BXJ2 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Trerf1Q8BXJ2 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Trerf1Q8BXJ2 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Trerf1Q8BXJ2 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Trerf1Q8BXJ2 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Trerf1Q8BXJ2 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
Trerf1Q8BXJ2 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Trerf1Q8BXJ2 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Trerf1Q8BXJ2 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Trerf1Q8BXJ2 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Trerf1Q8BXJ2 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Trerf1Q8BXJ2 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Trerf1Q8BXJ2 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Trerf1Q8BXJ2 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Trerf1Q8BXJ2 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Trerf1Q8BXJ2 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC26.45■■□□□ 1.83
Trerf1Q8BXJ2 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Trerf1Q8BXJ2 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Trerf1Q8BXJ2 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Trerf1Q8BXJ2 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Trerf1Q8BXJ2 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Trerf1Q8BXJ2 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Trerf1Q8BXJ2 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Trerf1Q8BXJ2 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Trerf1Q8BXJ2 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Trerf1Q8BXJ2 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Trerf1Q8BXJ2 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Trerf1Q8BXJ2 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Trerf1Q8BXJ2 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Trerf1Q8BXJ2 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Trerf1Q8BXJ2 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Trerf1Q8BXJ2 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Trerf1Q8BXJ2 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Trerf1Q8BXJ2 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
Trerf1Q8BXJ2 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Trerf1Q8BXJ2 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Trerf1Q8BXJ2 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
Trerf1Q8BXJ2 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Trerf1Q8BXJ2 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Trerf1Q8BXJ2 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Trerf1Q8BXJ2 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Trerf1Q8BXJ2 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Trerf1Q8BXJ2 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Trerf1Q8BXJ2 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Trerf1Q8BXJ2 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Trerf1Q8BXJ2 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Trerf1Q8BXJ2 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Trerf1Q8BXJ2 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Trerf1Q8BXJ2 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Trerf1Q8BXJ2 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Trerf1Q8BXJ2 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Trerf1Q8BXJ2 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Trerf1Q8BXJ2 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Trerf1Q8BXJ2 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
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