Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX22

Sall4, Sal-like protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,067 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sall4Q8BX22 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Sall4Q8BX22 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Sall4Q8BX22 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Sall4Q8BX22 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Sall4Q8BX22 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Sall4Q8BX22 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Sall4Q8BX22 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Sall4Q8BX22 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Sall4Q8BX22 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Sall4Q8BX22 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Sall4Q8BX22 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Sall4Q8BX22 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Sall4Q8BX22 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Sall4Q8BX22 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Sall4Q8BX22 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Sall4Q8BX22 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Sall4Q8BX22 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Sall4Q8BX22 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Sall4Q8BX22 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Sall4Q8BX22 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Sall4Q8BX22 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Sall4Q8BX22 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Sall4Q8BX22 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Sall4Q8BX22 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Sall4Q8BX22 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Sall4Q8BX22 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Sall4Q8BX22 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Sall4Q8BX22 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Sall4Q8BX22 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Sall4Q8BX22 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Sall4Q8BX22 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Sall4Q8BX22 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Sall4Q8BX22 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Sall4Q8BX22 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Sall4Q8BX22 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Sall4Q8BX22 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Sall4Q8BX22 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Sall4Q8BX22 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Sall4Q8BX22 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Sall4Q8BX22 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Sall4Q8BX22 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Sall4Q8BX22 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Sall4Q8BX22 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Sall4Q8BX22 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Sall4Q8BX22 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Sall4Q8BX22 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Sall4Q8BX22 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Sall4Q8BX22 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Sall4Q8BX22 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Sall4Q8BX22 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Sall4Q8BX22 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Sall4Q8BX22 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Sall4Q8BX22 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Sall4Q8BX22 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Sall4Q8BX22 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Sall4Q8BX22 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Sall4Q8BX22 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Sall4Q8BX22 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Sall4Q8BX22 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Sall4Q8BX22 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Sall4Q8BX22 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Sall4Q8BX22 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Sall4Q8BX22 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Sall4Q8BX22 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Sall4Q8BX22 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Sall4Q8BX22 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Sall4Q8BX22 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Sall4Q8BX22 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sall4Q8BX22 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sall4Q8BX22 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Sall4Q8BX22 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sall4Q8BX22 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sall4Q8BX22 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Sall4Q8BX22 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Sall4Q8BX22 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Sall4Q8BX22 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sall4Q8BX22 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sall4Q8BX22 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sall4Q8BX22 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sall4Q8BX22 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sall4Q8BX22 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sall4Q8BX22 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sall4Q8BX22 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sall4Q8BX22 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sall4Q8BX22 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sall4Q8BX22 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Sall4Q8BX22 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sall4Q8BX22 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sall4Q8BX22 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sall4Q8BX22 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sall4Q8BX22 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sall4Q8BX22 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sall4Q8BX22 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sall4Q8BX22 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sall4Q8BX22 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Sall4Q8BX22 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Sall4Q8BX22 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sall4Q8BX22 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sall4Q8BX22 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Sall4Q8BX22 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms