Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMK4

Ckap4, Cytoskeleton-associated protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckap4Q8BMK4 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ckap4Q8BMK4 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Ckap4Q8BMK4 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Ckap4Q8BMK4 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ckap4Q8BMK4 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ckap4Q8BMK4 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ckap4Q8BMK4 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ckap4Q8BMK4 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ckap4Q8BMK4 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ckap4Q8BMK4 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ckap4Q8BMK4 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ckap4Q8BMK4 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ckap4Q8BMK4 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ckap4Q8BMK4 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Ckap4Q8BMK4 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ckap4Q8BMK4 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Ckap4Q8BMK4 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ckap4Q8BMK4 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ckap4Q8BMK4 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Ckap4Q8BMK4 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ckap4Q8BMK4 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Ckap4Q8BMK4 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ckap4Q8BMK4 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Ckap4Q8BMK4 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ckap4Q8BMK4 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ckap4Q8BMK4 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ckap4Q8BMK4 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ckap4Q8BMK4 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ckap4Q8BMK4 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ckap4Q8BMK4 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ckap4Q8BMK4 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ckap4Q8BMK4 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ckap4Q8BMK4 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ckap4Q8BMK4 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ckap4Q8BMK4 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ckap4Q8BMK4 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ckap4Q8BMK4 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ckap4Q8BMK4 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ckap4Q8BMK4 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Ckap4Q8BMK4 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ckap4Q8BMK4 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Ckap4Q8BMK4 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ckap4Q8BMK4 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Ckap4Q8BMK4 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Ckap4Q8BMK4 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ckap4Q8BMK4 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ckap4Q8BMK4 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ckap4Q8BMK4 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ckap4Q8BMK4 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Ckap4Q8BMK4 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ckap4Q8BMK4 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ckap4Q8BMK4 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ckap4Q8BMK4 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ckap4Q8BMK4 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ckap4Q8BMK4 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ckap4Q8BMK4 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ckap4Q8BMK4 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ckap4Q8BMK4 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ckap4Q8BMK4 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ckap4Q8BMK4 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ckap4Q8BMK4 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ckap4Q8BMK4 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ckap4Q8BMK4 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ckap4Q8BMK4 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ckap4Q8BMK4 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ckap4Q8BMK4 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ckap4Q8BMK4 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ckap4Q8BMK4 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ckap4Q8BMK4 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ckap4Q8BMK4 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ckap4Q8BMK4 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ckap4Q8BMK4 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ckap4Q8BMK4 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ckap4Q8BMK4 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ckap4Q8BMK4 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ckap4Q8BMK4 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ckap4Q8BMK4 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ckap4Q8BMK4 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ckap4Q8BMK4 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ckap4Q8BMK4 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ckap4Q8BMK4 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ckap4Q8BMK4 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ckap4Q8BMK4 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ckap4Q8BMK4 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ckap4Q8BMK4 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ckap4Q8BMK4 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ckap4Q8BMK4 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ckap4Q8BMK4 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ckap4Q8BMK4 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Ckap4Q8BMK4 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ckap4Q8BMK4 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ckap4Q8BMK4 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ckap4Q8BMK4 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ckap4Q8BMK4 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ckap4Q8BMK4 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ckap4Q8BMK4 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ckap4Q8BMK4 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ckap4Q8BMK4 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ckap4Q8BMK4 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ckap4Q8BMK4 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.5 ms