Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJN4

Fndc9, Fibronectin type III domain-containing protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc9Q8BJN4 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Fndc9Q8BJN4 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Fndc9Q8BJN4 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Fndc9Q8BJN4 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Fndc9Q8BJN4 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Fndc9Q8BJN4 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Fndc9Q8BJN4 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Fndc9Q8BJN4 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Fndc9Q8BJN4 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Fndc9Q8BJN4 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Fndc9Q8BJN4 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Fndc9Q8BJN4 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Fndc9Q8BJN4 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Fndc9Q8BJN4 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Fndc9Q8BJN4 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Fndc9Q8BJN4 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Fndc9Q8BJN4 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Fndc9Q8BJN4 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Fndc9Q8BJN4 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Fndc9Q8BJN4 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Fndc9Q8BJN4 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Fndc9Q8BJN4 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Fndc9Q8BJN4 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Fndc9Q8BJN4 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Fndc9Q8BJN4 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Fndc9Q8BJN4 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Fndc9Q8BJN4 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Fndc9Q8BJN4 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Fndc9Q8BJN4 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Fndc9Q8BJN4 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Fndc9Q8BJN4 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Fndc9Q8BJN4 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Fndc9Q8BJN4 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Fndc9Q8BJN4 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Fndc9Q8BJN4 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Fndc9Q8BJN4 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Fndc9Q8BJN4 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Fndc9Q8BJN4 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Fndc9Q8BJN4 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Fndc9Q8BJN4 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Fndc9Q8BJN4 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Fndc9Q8BJN4 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Fndc9Q8BJN4 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Fndc9Q8BJN4 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Fndc9Q8BJN4 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Fndc9Q8BJN4 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Fndc9Q8BJN4 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Fndc9Q8BJN4 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Fndc9Q8BJN4 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Fndc9Q8BJN4 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Fndc9Q8BJN4 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Fndc9Q8BJN4 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Fndc9Q8BJN4 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Fndc9Q8BJN4 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Fndc9Q8BJN4 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Fndc9Q8BJN4 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Fndc9Q8BJN4 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Fndc9Q8BJN4 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Fndc9Q8BJN4 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Fndc9Q8BJN4 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Fndc9Q8BJN4 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Fndc9Q8BJN4 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Fndc9Q8BJN4 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Fndc9Q8BJN4 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Fndc9Q8BJN4 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Fndc9Q8BJN4 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Fndc9Q8BJN4 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Fndc9Q8BJN4 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Fndc9Q8BJN4 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Fndc9Q8BJN4 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Fndc9Q8BJN4 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Fndc9Q8BJN4 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Fndc9Q8BJN4 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Fndc9Q8BJN4 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Fndc9Q8BJN4 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Fndc9Q8BJN4 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Fndc9Q8BJN4 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Fndc9Q8BJN4 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Fndc9Q8BJN4 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Fndc9Q8BJN4 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Fndc9Q8BJN4 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Fndc9Q8BJN4 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Fndc9Q8BJN4 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Fndc9Q8BJN4 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Fndc9Q8BJN4 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Fndc9Q8BJN4 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Fndc9Q8BJN4 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Fndc9Q8BJN4 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Fndc9Q8BJN4 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Fndc9Q8BJN4 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Fndc9Q8BJN4 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Fndc9Q8BJN4 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Fndc9Q8BJN4 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Fndc9Q8BJN4 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Fndc9Q8BJN4 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Fndc9Q8BJN4 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Fndc9Q8BJN4 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Fndc9Q8BJN4 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Fndc9Q8BJN4 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Fndc9Q8BJN4 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms