Protein–RNA interactions for Protein: Q8BH58

Tiprl, TIP41-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TiprlQ8BH58 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TiprlQ8BH58 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
TiprlQ8BH58 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TiprlQ8BH58 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TiprlQ8BH58 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TiprlQ8BH58 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TiprlQ8BH58 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TiprlQ8BH58 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TiprlQ8BH58 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TiprlQ8BH58 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TiprlQ8BH58 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TiprlQ8BH58 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TiprlQ8BH58 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TiprlQ8BH58 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TiprlQ8BH58 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TiprlQ8BH58 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TiprlQ8BH58 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TiprlQ8BH58 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TiprlQ8BH58 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TiprlQ8BH58 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TiprlQ8BH58 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TiprlQ8BH58 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TiprlQ8BH58 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TiprlQ8BH58 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TiprlQ8BH58 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TiprlQ8BH58 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TiprlQ8BH58 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TiprlQ8BH58 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TiprlQ8BH58 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
TiprlQ8BH58 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TiprlQ8BH58 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TiprlQ8BH58 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TiprlQ8BH58 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TiprlQ8BH58 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TiprlQ8BH58 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TiprlQ8BH58 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TiprlQ8BH58 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
TiprlQ8BH58 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TiprlQ8BH58 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TiprlQ8BH58 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
TiprlQ8BH58 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
TiprlQ8BH58 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TiprlQ8BH58 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TiprlQ8BH58 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TiprlQ8BH58 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TiprlQ8BH58 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
TiprlQ8BH58 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TiprlQ8BH58 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TiprlQ8BH58 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TiprlQ8BH58 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TiprlQ8BH58 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TiprlQ8BH58 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
TiprlQ8BH58 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TiprlQ8BH58 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TiprlQ8BH58 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TiprlQ8BH58 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TiprlQ8BH58 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TiprlQ8BH58 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TiprlQ8BH58 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TiprlQ8BH58 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TiprlQ8BH58 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TiprlQ8BH58 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TiprlQ8BH58 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TiprlQ8BH58 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TiprlQ8BH58 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TiprlQ8BH58 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TiprlQ8BH58 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TiprlQ8BH58 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TiprlQ8BH58 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TiprlQ8BH58 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TiprlQ8BH58 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TiprlQ8BH58 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TiprlQ8BH58 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TiprlQ8BH58 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TiprlQ8BH58 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TiprlQ8BH58 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
TiprlQ8BH58 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TiprlQ8BH58 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TiprlQ8BH58 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TiprlQ8BH58 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TiprlQ8BH58 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TiprlQ8BH58 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TiprlQ8BH58 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TiprlQ8BH58 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TiprlQ8BH58 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TiprlQ8BH58 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TiprlQ8BH58 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TiprlQ8BH58 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TiprlQ8BH58 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TiprlQ8BH58 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TiprlQ8BH58 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TiprlQ8BH58 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TiprlQ8BH58 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TiprlQ8BH58 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TiprlQ8BH58 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
TiprlQ8BH58 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TiprlQ8BH58 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TiprlQ8BH58 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TiprlQ8BH58 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TiprlQ8BH58 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms