Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGA3

Lrrtm2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm2Q8BGA3 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Lrrtm2Q8BGA3 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Lrrtm2Q8BGA3 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Lrrtm2Q8BGA3 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Lrrtm2Q8BGA3 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Lrrtm2Q8BGA3 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Lrrtm2Q8BGA3 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Lrrtm2Q8BGA3 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Lrrtm2Q8BGA3 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Lrrtm2Q8BGA3 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Lrrtm2Q8BGA3 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Lrrtm2Q8BGA3 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Lrrtm2Q8BGA3 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Lrrtm2Q8BGA3 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Lrrtm2Q8BGA3 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Lrrtm2Q8BGA3 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Lrrtm2Q8BGA3 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Lrrtm2Q8BGA3 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Lrrtm2Q8BGA3 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Lrrtm2Q8BGA3 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Lrrtm2Q8BGA3 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Lrrtm2Q8BGA3 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Lrrtm2Q8BGA3 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Lrrtm2Q8BGA3 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Lrrtm2Q8BGA3 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Lrrtm2Q8BGA3 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Lrrtm2Q8BGA3 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Lrrtm2Q8BGA3 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Lrrtm2Q8BGA3 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Lrrtm2Q8BGA3 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Lrrtm2Q8BGA3 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Lrrtm2Q8BGA3 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Lrrtm2Q8BGA3 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Lrrtm2Q8BGA3 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Lrrtm2Q8BGA3 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Lrrtm2Q8BGA3 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Lrrtm2Q8BGA3 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Lrrtm2Q8BGA3 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Lrrtm2Q8BGA3 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Lrrtm2Q8BGA3 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Lrrtm2Q8BGA3 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Lrrtm2Q8BGA3 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Lrrtm2Q8BGA3 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Lrrtm2Q8BGA3 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Lrrtm2Q8BGA3 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Lrrtm2Q8BGA3 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Lrrtm2Q8BGA3 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Lrrtm2Q8BGA3 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Lrrtm2Q8BGA3 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Lrrtm2Q8BGA3 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Lrrtm2Q8BGA3 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Lrrtm2Q8BGA3 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Lrrtm2Q8BGA3 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Lrrtm2Q8BGA3 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Lrrtm2Q8BGA3 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Lrrtm2Q8BGA3 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Lrrtm2Q8BGA3 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Lrrtm2Q8BGA3 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Lrrtm2Q8BGA3 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Lrrtm2Q8BGA3 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Lrrtm2Q8BGA3 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Lrrtm2Q8BGA3 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Lrrtm2Q8BGA3 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Lrrtm2Q8BGA3 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Lrrtm2Q8BGA3 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Lrrtm2Q8BGA3 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Lrrtm2Q8BGA3 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Lrrtm2Q8BGA3 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Lrrtm2Q8BGA3 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Lrrtm2Q8BGA3 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Lrrtm2Q8BGA3 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Lrrtm2Q8BGA3 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Lrrtm2Q8BGA3 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Lrrtm2Q8BGA3 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Lrrtm2Q8BGA3 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Lrrtm2Q8BGA3 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Lrrtm2Q8BGA3 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Lrrtm2Q8BGA3 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Lrrtm2Q8BGA3 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Lrrtm2Q8BGA3 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Lrrtm2Q8BGA3 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Lrrtm2Q8BGA3 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Lrrtm2Q8BGA3 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Lrrtm2Q8BGA3 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Lrrtm2Q8BGA3 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Lrrtm2Q8BGA3 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Lrrtm2Q8BGA3 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Lrrtm2Q8BGA3 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Lrrtm2Q8BGA3 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Lrrtm2Q8BGA3 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Lrrtm2Q8BGA3 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Lrrtm2Q8BGA3 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Lrrtm2Q8BGA3 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Lrrtm2Q8BGA3 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Lrrtm2Q8BGA3 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Lrrtm2Q8BGA3 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Lrrtm2Q8BGA3 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Lrrtm2Q8BGA3 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Lrrtm2Q8BGA3 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Lrrtm2Q8BGA3 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.7 ms