Protein–RNA interactions for Protein: Q80Z71

Tnn, Tenascin-N, mousemouse

Predictions only

Length 1,560 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TnnQ80Z71 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC45.24■■■■■ 4.83
TnnQ80Z71 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC45.17■■■■■ 4.82
TnnQ80Z71 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.13■■■■■ 4.82
TnnQ80Z71 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC45.13■■■■■ 4.82
TnnQ80Z71 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC45.08■■■■■ 4.81
TnnQ80Z71 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC45.08■■■■■ 4.81
TnnQ80Z71 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC45.07■■■■■ 4.81
TnnQ80Z71 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC45.07■■■■■ 4.81
TnnQ80Z71 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC45.06■■■■■ 4.8
TnnQ80Z71 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC45■■■■■ 4.79
TnnQ80Z71 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC44.98■■■■■ 4.79
TnnQ80Z71 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.97■■■■■ 4.79
TnnQ80Z71 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC44.97■■■■■ 4.79
TnnQ80Z71 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.95■■■■■ 4.79
TnnQ80Z71 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC44.95■■■■■ 4.79
TnnQ80Z71 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC44.92■■■■■ 4.78
TnnQ80Z71 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC44.89■■■■■ 4.78
TnnQ80Z71 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.88■■■■■ 4.78
TnnQ80Z71 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.88■■■■■ 4.78
TnnQ80Z71 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC44.88■■■■■ 4.78
TnnQ80Z71 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.85■■■■■ 4.77
TnnQ80Z71 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC44.84■■■■■ 4.77
TnnQ80Z71 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.8■■■■■ 4.76
TnnQ80Z71 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC44.78■■■■■ 4.76
TnnQ80Z71 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC44.78■■■■■ 4.76
TnnQ80Z71 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC44.75■■■■■ 4.75
TnnQ80Z71 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.73■■■■■ 4.75
TnnQ80Z71 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC44.72■■■■■ 4.75
TnnQ80Z71 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.7■■■■■ 4.75
TnnQ80Z71 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.68■■■■■ 4.74
TnnQ80Z71 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.67■■■■■ 4.74
TnnQ80Z71 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC44.66■■■■■ 4.74
TnnQ80Z71 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.65■■■■■ 4.74
TnnQ80Z71 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC44.63■■■■■ 4.73
TnnQ80Z71 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC44.6■■■■■ 4.73
TnnQ80Z71 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.6■■■■■ 4.73
TnnQ80Z71 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.58■■■■■ 4.73
TnnQ80Z71 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC44.55■■■■■ 4.72
TnnQ80Z71 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.5■■■■■ 4.71
TnnQ80Z71 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.49■■■■■ 4.71
TnnQ80Z71 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.49■■■■■ 4.71
TnnQ80Z71 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.47■■■■■ 4.71
TnnQ80Z71 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.45■■■■■ 4.71
TnnQ80Z71 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC44.44■■■■■ 4.71
TnnQ80Z71 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC44.44■■■■■ 4.7
TnnQ80Z71 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.43■■■■■ 4.7
TnnQ80Z71 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.43■■■■■ 4.7
TnnQ80Z71 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC44.42■■■■■ 4.7
TnnQ80Z71 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC44.39■■■■■ 4.7
TnnQ80Z71 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC44.37■■■■■ 4.69
TnnQ80Z71 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.35■■■■■ 4.69
TnnQ80Z71 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC44.35■■■■■ 4.69
TnnQ80Z71 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.34■■■■■ 4.69
TnnQ80Z71 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC44.32■■■■■ 4.69
TnnQ80Z71 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.31■■■■■ 4.68
TnnQ80Z71 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC44.29■■■■■ 4.68
TnnQ80Z71 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.29■■■■■ 4.68
TnnQ80Z71 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.29■■■■■ 4.68
TnnQ80Z71 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.28■■■■■ 4.68
TnnQ80Z71 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC44.27■■■■■ 4.68
TnnQ80Z71 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC44.27■■■■■ 4.68
TnnQ80Z71 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.26■■■■■ 4.68
TnnQ80Z71 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.25■■■■■ 4.67
TnnQ80Z71 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.25■■■■■ 4.67
TnnQ80Z71 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.25■■■■■ 4.67
TnnQ80Z71 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC44.22■■■■■ 4.67
TnnQ80Z71 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.21■■■■■ 4.67
TnnQ80Z71 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC44.21■■■■■ 4.67
TnnQ80Z71 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC44.21■■■■■ 4.67
TnnQ80Z71 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC44.19■■■■■ 4.66
TnnQ80Z71 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC44.18■■■■■ 4.66
TnnQ80Z71 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC44.14■■■■■ 4.66
TnnQ80Z71 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC44.13■■■■■ 4.65
TnnQ80Z71 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC44.11■■■■■ 4.65
TnnQ80Z71 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.09■■■■■ 4.65
TnnQ80Z71 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC43.99■■■■■ 4.63
TnnQ80Z71 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.95■■■■■ 4.63
TnnQ80Z71 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.95■■■■■ 4.63
TnnQ80Z71 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC43.93■■■■■ 4.62
TnnQ80Z71 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.93■■■■■ 4.62
TnnQ80Z71 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC43.92■■■■■ 4.62
TnnQ80Z71 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC43.91■■■■■ 4.62
TnnQ80Z71 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.91■■■■■ 4.62
TnnQ80Z71 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC43.88■■■■■ 4.62
TnnQ80Z71 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.86■■■■■ 4.61
TnnQ80Z71 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.84■■■■■ 4.61
TnnQ80Z71 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC43.84■■■■■ 4.61
TnnQ80Z71 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.83■■■■■ 4.61
TnnQ80Z71 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.82■■■■■ 4.61
TnnQ80Z71 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC43.82■■■■■ 4.61
TnnQ80Z71 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.82■■■■■ 4.6
TnnQ80Z71 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC43.8■■■■■ 4.6
TnnQ80Z71 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.77■■■■■ 4.6
TnnQ80Z71 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.77■■■■■ 4.6
TnnQ80Z71 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.77■■■■■ 4.6
TnnQ80Z71 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.75■■■■■ 4.59
TnnQ80Z71 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC43.71■■■■■ 4.59
TnnQ80Z71 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.71■■■■■ 4.59
TnnQ80Z71 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.7■■■■■ 4.59
TnnQ80Z71 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC43.7■■■■■ 4.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms