Protein–RNA interactions for Protein: Q80W37

Snupn, Snurportin-1, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnupnQ80W37 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SnupnQ80W37 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SnupnQ80W37 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SnupnQ80W37 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SnupnQ80W37 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SnupnQ80W37 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SnupnQ80W37 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SnupnQ80W37 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SnupnQ80W37 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SnupnQ80W37 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SnupnQ80W37 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SnupnQ80W37 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SnupnQ80W37 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
SnupnQ80W37 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SnupnQ80W37 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
SnupnQ80W37 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SnupnQ80W37 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SnupnQ80W37 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
SnupnQ80W37 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SnupnQ80W37 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
SnupnQ80W37 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SnupnQ80W37 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SnupnQ80W37 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SnupnQ80W37 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SnupnQ80W37 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SnupnQ80W37 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SnupnQ80W37 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SnupnQ80W37 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
SnupnQ80W37 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SnupnQ80W37 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SnupnQ80W37 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SnupnQ80W37 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SnupnQ80W37 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SnupnQ80W37 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SnupnQ80W37 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SnupnQ80W37 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SnupnQ80W37 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SnupnQ80W37 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SnupnQ80W37 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SnupnQ80W37 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SnupnQ80W37 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SnupnQ80W37 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SnupnQ80W37 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SnupnQ80W37 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SnupnQ80W37 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SnupnQ80W37 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SnupnQ80W37 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SnupnQ80W37 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SnupnQ80W37 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SnupnQ80W37 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SnupnQ80W37 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SnupnQ80W37 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SnupnQ80W37 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SnupnQ80W37 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SnupnQ80W37 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SnupnQ80W37 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SnupnQ80W37 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SnupnQ80W37 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
SnupnQ80W37 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SnupnQ80W37 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
SnupnQ80W37 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SnupnQ80W37 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SnupnQ80W37 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SnupnQ80W37 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SnupnQ80W37 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SnupnQ80W37 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SnupnQ80W37 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SnupnQ80W37 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SnupnQ80W37 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SnupnQ80W37 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SnupnQ80W37 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SnupnQ80W37 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SnupnQ80W37 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SnupnQ80W37 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SnupnQ80W37 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
SnupnQ80W37 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SnupnQ80W37 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SnupnQ80W37 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SnupnQ80W37 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.55
SnupnQ80W37 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SnupnQ80W37 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SnupnQ80W37 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SnupnQ80W37 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SnupnQ80W37 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SnupnQ80W37 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SnupnQ80W37 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SnupnQ80W37 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SnupnQ80W37 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SnupnQ80W37 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SnupnQ80W37 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SnupnQ80W37 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SnupnQ80W37 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SnupnQ80W37 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SnupnQ80W37 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SnupnQ80W37 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SnupnQ80W37 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SnupnQ80W37 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SnupnQ80W37 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SnupnQ80W37 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SnupnQ80W37 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms