Protein–RNA interactions for Protein: Q80U04

Pja2, E3 ubiquitin-protein ligase Praja-2, mousemouse

Predictions only

Length 707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pja2Q80U04 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Pja2Q80U04 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Pja2Q80U04 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Pja2Q80U04 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Pja2Q80U04 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Pja2Q80U04 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Pja2Q80U04 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Pja2Q80U04 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Pja2Q80U04 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Pja2Q80U04 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Pja2Q80U04 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Pja2Q80U04 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Pja2Q80U04 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Pja2Q80U04 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Pja2Q80U04 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Pja2Q80U04 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Pja2Q80U04 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Pja2Q80U04 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Pja2Q80U04 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Pja2Q80U04 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Pja2Q80U04 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Pja2Q80U04 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
Pja2Q80U04 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Pja2Q80U04 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Pja2Q80U04 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Pja2Q80U04 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
Pja2Q80U04 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Pja2Q80U04 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
Pja2Q80U04 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Pja2Q80U04 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Pja2Q80U04 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Pja2Q80U04 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Pja2Q80U04 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Pja2Q80U04 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Pja2Q80U04 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Pja2Q80U04 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Pja2Q80U04 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Pja2Q80U04 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Pja2Q80U04 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Pja2Q80U04 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Pja2Q80U04 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Pja2Q80U04 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
Pja2Q80U04 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
Pja2Q80U04 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Pja2Q80U04 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Pja2Q80U04 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Pja2Q80U04 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Pja2Q80U04 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Pja2Q80U04 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Pja2Q80U04 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Pja2Q80U04 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Pja2Q80U04 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Pja2Q80U04 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Pja2Q80U04 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Pja2Q80U04 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Pja2Q80U04 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Pja2Q80U04 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Pja2Q80U04 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
Pja2Q80U04 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Pja2Q80U04 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Pja2Q80U04 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Pja2Q80U04 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Pja2Q80U04 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Pja2Q80U04 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Pja2Q80U04 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
Pja2Q80U04 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Pja2Q80U04 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Pja2Q80U04 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Pja2Q80U04 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Pja2Q80U04 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Pja2Q80U04 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Pja2Q80U04 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Pja2Q80U04 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Pja2Q80U04 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Pja2Q80U04 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Pja2Q80U04 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Pja2Q80U04 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
Pja2Q80U04 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Pja2Q80U04 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Pja2Q80U04 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Pja2Q80U04 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Pja2Q80U04 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Pja2Q80U04 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Pja2Q80U04 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Pja2Q80U04 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Pja2Q80U04 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Pja2Q80U04 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
Pja2Q80U04 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Pja2Q80U04 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Pja2Q80U04 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Pja2Q80U04 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
Pja2Q80U04 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Pja2Q80U04 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Pja2Q80U04 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Pja2Q80U04 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Pja2Q80U04 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Pja2Q80U04 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
Pja2Q80U04 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Pja2Q80U04 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Pja2Q80U04 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms