Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSK3

Pcdh8, Protocadherin-8, mousemouse

Predictions only

Length 1,070 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcdh8Q7TSK3 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Pcdh8Q7TSK3 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Pcdh8Q7TSK3 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Pcdh8Q7TSK3 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Pcdh8Q7TSK3 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
Pcdh8Q7TSK3 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Pcdh8Q7TSK3 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Pcdh8Q7TSK3 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Pcdh8Q7TSK3 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Pcdh8Q7TSK3 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Pcdh8Q7TSK3 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Pcdh8Q7TSK3 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.72
Pcdh8Q7TSK3 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Pcdh8Q7TSK3 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Pcdh8Q7TSK3 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Pcdh8Q7TSK3 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Pcdh8Q7TSK3 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Pcdh8Q7TSK3 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Pcdh8Q7TSK3 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Pcdh8Q7TSK3 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Pcdh8Q7TSK3 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Pcdh8Q7TSK3 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Pcdh8Q7TSK3 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Pcdh8Q7TSK3 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Pcdh8Q7TSK3 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Pcdh8Q7TSK3 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Pcdh8Q7TSK3 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Pcdh8Q7TSK3 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Pcdh8Q7TSK3 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Pcdh8Q7TSK3 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Pcdh8Q7TSK3 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Pcdh8Q7TSK3 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Pcdh8Q7TSK3 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Pcdh8Q7TSK3 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Pcdh8Q7TSK3 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Pcdh8Q7TSK3 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Pcdh8Q7TSK3 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Pcdh8Q7TSK3 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Pcdh8Q7TSK3 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Pcdh8Q7TSK3 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Pcdh8Q7TSK3 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Pcdh8Q7TSK3 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Pcdh8Q7TSK3 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Pcdh8Q7TSK3 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Pcdh8Q7TSK3 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Pcdh8Q7TSK3 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Pcdh8Q7TSK3 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Pcdh8Q7TSK3 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Pcdh8Q7TSK3 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Pcdh8Q7TSK3 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Pcdh8Q7TSK3 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Pcdh8Q7TSK3 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Pcdh8Q7TSK3 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Pcdh8Q7TSK3 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Pcdh8Q7TSK3 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Pcdh8Q7TSK3 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Pcdh8Q7TSK3 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Pcdh8Q7TSK3 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Pcdh8Q7TSK3 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Pcdh8Q7TSK3 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Pcdh8Q7TSK3 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Pcdh8Q7TSK3 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Pcdh8Q7TSK3 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Pcdh8Q7TSK3 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Pcdh8Q7TSK3 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Pcdh8Q7TSK3 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Pcdh8Q7TSK3 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Pcdh8Q7TSK3 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Pcdh8Q7TSK3 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Pcdh8Q7TSK3 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Pcdh8Q7TSK3 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Pcdh8Q7TSK3 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Pcdh8Q7TSK3 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Pcdh8Q7TSK3 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Pcdh8Q7TSK3 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Pcdh8Q7TSK3 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Pcdh8Q7TSK3 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Pcdh8Q7TSK3 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Pcdh8Q7TSK3 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Pcdh8Q7TSK3 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Pcdh8Q7TSK3 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Pcdh8Q7TSK3 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Pcdh8Q7TSK3 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Pcdh8Q7TSK3 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Pcdh8Q7TSK3 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Pcdh8Q7TSK3 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Pcdh8Q7TSK3 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Pcdh8Q7TSK3 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Pcdh8Q7TSK3 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Pcdh8Q7TSK3 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Pcdh8Q7TSK3 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Pcdh8Q7TSK3 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Pcdh8Q7TSK3 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Pcdh8Q7TSK3 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Pcdh8Q7TSK3 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Pcdh8Q7TSK3 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Pcdh8Q7TSK3 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Pcdh8Q7TSK3 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Pcdh8Q7TSK3 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Pcdh8Q7TSK3 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 469.5 ms