Protein–RNA interactions for Protein: Q7TQC5

Aptx, Aprataxin, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AptxQ7TQC5 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
AptxQ7TQC5 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
AptxQ7TQC5 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
AptxQ7TQC5 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
AptxQ7TQC5 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
AptxQ7TQC5 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
AptxQ7TQC5 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
AptxQ7TQC5 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
AptxQ7TQC5 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
AptxQ7TQC5 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
AptxQ7TQC5 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
AptxQ7TQC5 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
AptxQ7TQC5 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
AptxQ7TQC5 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
AptxQ7TQC5 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
AptxQ7TQC5 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
AptxQ7TQC5 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
AptxQ7TQC5 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
AptxQ7TQC5 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
AptxQ7TQC5 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
AptxQ7TQC5 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
AptxQ7TQC5 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
AptxQ7TQC5 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
AptxQ7TQC5 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
AptxQ7TQC5 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
AptxQ7TQC5 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
AptxQ7TQC5 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
AptxQ7TQC5 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
AptxQ7TQC5 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
AptxQ7TQC5 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
AptxQ7TQC5 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
AptxQ7TQC5 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
AptxQ7TQC5 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
AptxQ7TQC5 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
AptxQ7TQC5 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
AptxQ7TQC5 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
AptxQ7TQC5 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
AptxQ7TQC5 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
AptxQ7TQC5 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
AptxQ7TQC5 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
AptxQ7TQC5 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
AptxQ7TQC5 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
AptxQ7TQC5 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
AptxQ7TQC5 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
AptxQ7TQC5 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
AptxQ7TQC5 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
AptxQ7TQC5 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
AptxQ7TQC5 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
AptxQ7TQC5 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
AptxQ7TQC5 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
AptxQ7TQC5 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
AptxQ7TQC5 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
AptxQ7TQC5 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
AptxQ7TQC5 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
AptxQ7TQC5 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
AptxQ7TQC5 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
AptxQ7TQC5 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
AptxQ7TQC5 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
AptxQ7TQC5 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
AptxQ7TQC5 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
AptxQ7TQC5 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
AptxQ7TQC5 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
AptxQ7TQC5 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
AptxQ7TQC5 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
AptxQ7TQC5 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
AptxQ7TQC5 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
AptxQ7TQC5 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
AptxQ7TQC5 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
AptxQ7TQC5 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
AptxQ7TQC5 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
AptxQ7TQC5 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
AptxQ7TQC5 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
AptxQ7TQC5 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
AptxQ7TQC5 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
AptxQ7TQC5 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
AptxQ7TQC5 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
AptxQ7TQC5 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
AptxQ7TQC5 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
AptxQ7TQC5 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
AptxQ7TQC5 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
AptxQ7TQC5 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
AptxQ7TQC5 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
AptxQ7TQC5 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
AptxQ7TQC5 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
AptxQ7TQC5 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
AptxQ7TQC5 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
AptxQ7TQC5 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
AptxQ7TQC5 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
AptxQ7TQC5 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
AptxQ7TQC5 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
AptxQ7TQC5 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
AptxQ7TQC5 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
AptxQ7TQC5 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
AptxQ7TQC5 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
AptxQ7TQC5 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
AptxQ7TQC5 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
AptxQ7TQC5 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
AptxQ7TQC5 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
AptxQ7TQC5 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
AptxQ7TQC5 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.3 ms