Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPR4

Actn1, Alpha-actinin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 892 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actn1Q7TPR4 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Actn1Q7TPR4 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Actn1Q7TPR4 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
Actn1Q7TPR4 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Actn1Q7TPR4 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Actn1Q7TPR4 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
Actn1Q7TPR4 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Actn1Q7TPR4 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Actn1Q7TPR4 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Actn1Q7TPR4 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Actn1Q7TPR4 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Actn1Q7TPR4 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Actn1Q7TPR4 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Actn1Q7TPR4 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Actn1Q7TPR4 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Actn1Q7TPR4 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Actn1Q7TPR4 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Actn1Q7TPR4 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Actn1Q7TPR4 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Actn1Q7TPR4 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Actn1Q7TPR4 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Actn1Q7TPR4 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Actn1Q7TPR4 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
Actn1Q7TPR4 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Actn1Q7TPR4 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Actn1Q7TPR4 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
Actn1Q7TPR4 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Actn1Q7TPR4 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Actn1Q7TPR4 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Actn1Q7TPR4 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Actn1Q7TPR4 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Actn1Q7TPR4 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Actn1Q7TPR4 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Actn1Q7TPR4 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Actn1Q7TPR4 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Actn1Q7TPR4 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC29■■■□□ 2.23
Actn1Q7TPR4 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Actn1Q7TPR4 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Actn1Q7TPR4 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Actn1Q7TPR4 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Actn1Q7TPR4 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Actn1Q7TPR4 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Actn1Q7TPR4 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Actn1Q7TPR4 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Actn1Q7TPR4 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
Actn1Q7TPR4 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Actn1Q7TPR4 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Actn1Q7TPR4 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Actn1Q7TPR4 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Actn1Q7TPR4 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Actn1Q7TPR4 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Actn1Q7TPR4 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Actn1Q7TPR4 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Actn1Q7TPR4 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Actn1Q7TPR4 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Actn1Q7TPR4 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Actn1Q7TPR4 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Actn1Q7TPR4 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Actn1Q7TPR4 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Actn1Q7TPR4 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Actn1Q7TPR4 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Actn1Q7TPR4 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Actn1Q7TPR4 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Actn1Q7TPR4 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Actn1Q7TPR4 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Actn1Q7TPR4 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
Actn1Q7TPR4 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Actn1Q7TPR4 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
Actn1Q7TPR4 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Actn1Q7TPR4 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Actn1Q7TPR4 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Actn1Q7TPR4 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Actn1Q7TPR4 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Actn1Q7TPR4 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Actn1Q7TPR4 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
Actn1Q7TPR4 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Actn1Q7TPR4 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Actn1Q7TPR4 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Actn1Q7TPR4 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Actn1Q7TPR4 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Actn1Q7TPR4 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Actn1Q7TPR4 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Actn1Q7TPR4 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Actn1Q7TPR4 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Actn1Q7TPR4 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Actn1Q7TPR4 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Actn1Q7TPR4 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Actn1Q7TPR4 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Actn1Q7TPR4 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Actn1Q7TPR4 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Actn1Q7TPR4 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Actn1Q7TPR4 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Actn1Q7TPR4 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Actn1Q7TPR4 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Actn1Q7TPR4 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Actn1Q7TPR4 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Actn1Q7TPR4 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Actn1Q7TPR4 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
Actn1Q7TPR4 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Actn1Q7TPR4 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms