Protein–RNA interactions for Protein: Q7TN05

Ap1s3, AP-1 complex subunit sigma-3, mousemouse

Predictions only

Length 154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap1s3Q7TN05 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ap1s3Q7TN05 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ap1s3Q7TN05 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ap1s3Q7TN05 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ap1s3Q7TN05 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ap1s3Q7TN05 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ap1s3Q7TN05 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ap1s3Q7TN05 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ap1s3Q7TN05 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ap1s3Q7TN05 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ap1s3Q7TN05 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ap1s3Q7TN05 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ap1s3Q7TN05 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ap1s3Q7TN05 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ap1s3Q7TN05 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ap1s3Q7TN05 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ap1s3Q7TN05 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ap1s3Q7TN05 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ap1s3Q7TN05 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ap1s3Q7TN05 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ap1s3Q7TN05 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ap1s3Q7TN05 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ap1s3Q7TN05 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ap1s3Q7TN05 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ap1s3Q7TN05 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Ap1s3Q7TN05 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ap1s3Q7TN05 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ap1s3Q7TN05 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ap1s3Q7TN05 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ap1s3Q7TN05 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ap1s3Q7TN05 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ap1s3Q7TN05 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ap1s3Q7TN05 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ap1s3Q7TN05 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ap1s3Q7TN05 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ap1s3Q7TN05 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ap1s3Q7TN05 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ap1s3Q7TN05 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ap1s3Q7TN05 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ap1s3Q7TN05 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ap1s3Q7TN05 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ap1s3Q7TN05 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ap1s3Q7TN05 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ap1s3Q7TN05 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ap1s3Q7TN05 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ap1s3Q7TN05 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ap1s3Q7TN05 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ap1s3Q7TN05 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Ap1s3Q7TN05 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ap1s3Q7TN05 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ap1s3Q7TN05 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ap1s3Q7TN05 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ap1s3Q7TN05 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ap1s3Q7TN05 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ap1s3Q7TN05 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ap1s3Q7TN05 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ap1s3Q7TN05 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ap1s3Q7TN05 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ap1s3Q7TN05 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ap1s3Q7TN05 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ap1s3Q7TN05 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ap1s3Q7TN05 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ap1s3Q7TN05 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ap1s3Q7TN05 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ap1s3Q7TN05 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ap1s3Q7TN05 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ap1s3Q7TN05 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ap1s3Q7TN05 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ap1s3Q7TN05 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ap1s3Q7TN05 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ap1s3Q7TN05 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ap1s3Q7TN05 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Ap1s3Q7TN05 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ap1s3Q7TN05 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ap1s3Q7TN05 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ap1s3Q7TN05 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ap1s3Q7TN05 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Ap1s3Q7TN05 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ap1s3Q7TN05 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ap1s3Q7TN05 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ap1s3Q7TN05 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ap1s3Q7TN05 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ap1s3Q7TN05 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ap1s3Q7TN05 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ap1s3Q7TN05 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ap1s3Q7TN05 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ap1s3Q7TN05 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Ap1s3Q7TN05 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ap1s3Q7TN05 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ap1s3Q7TN05 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ap1s3Q7TN05 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Ap1s3Q7TN05 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ap1s3Q7TN05 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ap1s3Q7TN05 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ap1s3Q7TN05 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ap1s3Q7TN05 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ap1s3Q7TN05 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ap1s3Q7TN05 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ap1s3Q7TN05 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ap1s3Q7TN05 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms