Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMY7

Ipo8, Importin-8, mousemouse

Predictions only

Length 1,010 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ipo8Q7TMY7 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC32.03■■■□□ 2.72
Ipo8Q7TMY7 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC32.01■■■□□ 2.72
Ipo8Q7TMY7 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC32.01■■■□□ 2.71
Ipo8Q7TMY7 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
Ipo8Q7TMY7 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.01■■■□□ 2.71
Ipo8Q7TMY7 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Ipo8Q7TMY7 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
Ipo8Q7TMY7 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
Ipo8Q7TMY7 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC31.96■■■□□ 2.71
Ipo8Q7TMY7 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
Ipo8Q7TMY7 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
Ipo8Q7TMY7 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
Ipo8Q7TMY7 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
Ipo8Q7TMY7 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC31.92■■■□□ 2.7
Ipo8Q7TMY7 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
Ipo8Q7TMY7 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
Ipo8Q7TMY7 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.88■■■□□ 2.69
Ipo8Q7TMY7 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
Ipo8Q7TMY7 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC31.87■■■□□ 2.69
Ipo8Q7TMY7 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.84■■■□□ 2.69
Ipo8Q7TMY7 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.84■■■□□ 2.69
Ipo8Q7TMY7 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
Ipo8Q7TMY7 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
Ipo8Q7TMY7 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
Ipo8Q7TMY7 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.83■■■□□ 2.69
Ipo8Q7TMY7 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC31.82■■■□□ 2.69
Ipo8Q7TMY7 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC31.81■■■□□ 2.68
Ipo8Q7TMY7 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
Ipo8Q7TMY7 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
Ipo8Q7TMY7 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC31.78■■■□□ 2.68
Ipo8Q7TMY7 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.76■■■□□ 2.68
Ipo8Q7TMY7 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
Ipo8Q7TMY7 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC31.73■■■□□ 2.67
Ipo8Q7TMY7 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
Ipo8Q7TMY7 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
Ipo8Q7TMY7 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
Ipo8Q7TMY7 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
Ipo8Q7TMY7 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.66
Ipo8Q7TMY7 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.66
Ipo8Q7TMY7 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
Ipo8Q7TMY7 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
Ipo8Q7TMY7 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
Ipo8Q7TMY7 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
Ipo8Q7TMY7 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
Ipo8Q7TMY7 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
Ipo8Q7TMY7 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC31.65■■■□□ 2.66
Ipo8Q7TMY7 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC31.64■■■□□ 2.66
Ipo8Q7TMY7 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
Ipo8Q7TMY7 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.65
Ipo8Q7TMY7 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
Ipo8Q7TMY7 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
Ipo8Q7TMY7 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
Ipo8Q7TMY7 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
Ipo8Q7TMY7 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
Ipo8Q7TMY7 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
Ipo8Q7TMY7 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.55■■■□□ 2.64
Ipo8Q7TMY7 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
Ipo8Q7TMY7 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
Ipo8Q7TMY7 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.54■■■□□ 2.64
Ipo8Q7TMY7 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
Ipo8Q7TMY7 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC31.52■■■□□ 2.64
Ipo8Q7TMY7 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
Ipo8Q7TMY7 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC31.51■■■□□ 2.64
Ipo8Q7TMY7 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC31.51■■■□□ 2.63
Ipo8Q7TMY7 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
Ipo8Q7TMY7 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
Ipo8Q7TMY7 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC31.49■■■□□ 2.63
Ipo8Q7TMY7 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
Ipo8Q7TMY7 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
Ipo8Q7TMY7 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
Ipo8Q7TMY7 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
Ipo8Q7TMY7 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
Ipo8Q7TMY7 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
Ipo8Q7TMY7 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
Ipo8Q7TMY7 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC31.38■■■□□ 2.61
Ipo8Q7TMY7 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
Ipo8Q7TMY7 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
Ipo8Q7TMY7 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
Ipo8Q7TMY7 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
Ipo8Q7TMY7 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC31.29■■■□□ 2.6
Ipo8Q7TMY7 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.28■■■□□ 2.6
Ipo8Q7TMY7 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.24■■■□□ 2.59
Ipo8Q7TMY7 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
Ipo8Q7TMY7 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC31.23■■■□□ 2.59
Ipo8Q7TMY7 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
Ipo8Q7TMY7 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.21■■■□□ 2.59
Ipo8Q7TMY7 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
Ipo8Q7TMY7 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
Ipo8Q7TMY7 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
Ipo8Q7TMY7 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
Ipo8Q7TMY7 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
Ipo8Q7TMY7 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
Ipo8Q7TMY7 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
Ipo8Q7TMY7 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
Ipo8Q7TMY7 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
Ipo8Q7TMY7 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.12■■■□□ 2.57
Ipo8Q7TMY7 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
Ipo8Q7TMY7 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC31.11■■■□□ 2.57
Ipo8Q7TMY7 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC31.09■■■□□ 2.57
Ipo8Q7TMY7 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms