Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMF3

Ndufa12, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 12, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufa12Q7TMF3 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ndufa12Q7TMF3 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ndufa12Q7TMF3 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ndufa12Q7TMF3 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Ndufa12Q7TMF3 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ndufa12Q7TMF3 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ndufa12Q7TMF3 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ndufa12Q7TMF3 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ndufa12Q7TMF3 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ndufa12Q7TMF3 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ndufa12Q7TMF3 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ndufa12Q7TMF3 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ndufa12Q7TMF3 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ndufa12Q7TMF3 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ndufa12Q7TMF3 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ndufa12Q7TMF3 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ndufa12Q7TMF3 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ndufa12Q7TMF3 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ndufa12Q7TMF3 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ndufa12Q7TMF3 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Ndufa12Q7TMF3 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ndufa12Q7TMF3 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ndufa12Q7TMF3 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ndufa12Q7TMF3 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ndufa12Q7TMF3 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Ndufa12Q7TMF3 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ndufa12Q7TMF3 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ndufa12Q7TMF3 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ndufa12Q7TMF3 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ndufa12Q7TMF3 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ndufa12Q7TMF3 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ndufa12Q7TMF3 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ndufa12Q7TMF3 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ndufa12Q7TMF3 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ndufa12Q7TMF3 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ndufa12Q7TMF3 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ndufa12Q7TMF3 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ndufa12Q7TMF3 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ndufa12Q7TMF3 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ndufa12Q7TMF3 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ndufa12Q7TMF3 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Ndufa12Q7TMF3 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Ndufa12Q7TMF3 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Ndufa12Q7TMF3 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ndufa12Q7TMF3 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ndufa12Q7TMF3 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ndufa12Q7TMF3 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ndufa12Q7TMF3 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ndufa12Q7TMF3 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ndufa12Q7TMF3 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ndufa12Q7TMF3 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ndufa12Q7TMF3 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ndufa12Q7TMF3 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ndufa12Q7TMF3 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ndufa12Q7TMF3 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ndufa12Q7TMF3 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Ndufa12Q7TMF3 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ndufa12Q7TMF3 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Ndufa12Q7TMF3 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Ndufa12Q7TMF3 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ndufa12Q7TMF3 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ndufa12Q7TMF3 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Ndufa12Q7TMF3 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ndufa12Q7TMF3 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ndufa12Q7TMF3 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Ndufa12Q7TMF3 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ndufa12Q7TMF3 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ndufa12Q7TMF3 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ndufa12Q7TMF3 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ndufa12Q7TMF3 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ndufa12Q7TMF3 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ndufa12Q7TMF3 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Ndufa12Q7TMF3 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ndufa12Q7TMF3 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ndufa12Q7TMF3 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ndufa12Q7TMF3 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ndufa12Q7TMF3 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ndufa12Q7TMF3 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ndufa12Q7TMF3 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ndufa12Q7TMF3 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ndufa12Q7TMF3 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ndufa12Q7TMF3 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ndufa12Q7TMF3 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Ndufa12Q7TMF3 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ndufa12Q7TMF3 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ndufa12Q7TMF3 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ndufa12Q7TMF3 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ndufa12Q7TMF3 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ndufa12Q7TMF3 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ndufa12Q7TMF3 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ndufa12Q7TMF3 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ndufa12Q7TMF3 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ndufa12Q7TMF3 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ndufa12Q7TMF3 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ndufa12Q7TMF3 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ndufa12Q7TMF3 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ndufa12Q7TMF3 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ndufa12Q7TMF3 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ndufa12Q7TMF3 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Ndufa12Q7TMF3 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms