Protein–RNA interactions for Protein: Q78IS1

Tmed3, Transmembrane emp24 domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed3Q78IS1 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tmed3Q78IS1 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tmed3Q78IS1 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tmed3Q78IS1 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tmed3Q78IS1 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tmed3Q78IS1 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tmed3Q78IS1 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tmed3Q78IS1 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tmed3Q78IS1 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tmed3Q78IS1 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tmed3Q78IS1 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tmed3Q78IS1 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tmed3Q78IS1 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tmed3Q78IS1 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tmed3Q78IS1 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tmed3Q78IS1 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tmed3Q78IS1 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tmed3Q78IS1 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tmed3Q78IS1 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Tmed3Q78IS1 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tmed3Q78IS1 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tmed3Q78IS1 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tmed3Q78IS1 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tmed3Q78IS1 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tmed3Q78IS1 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tmed3Q78IS1 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tmed3Q78IS1 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tmed3Q78IS1 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tmed3Q78IS1 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tmed3Q78IS1 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tmed3Q78IS1 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tmed3Q78IS1 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tmed3Q78IS1 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tmed3Q78IS1 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tmed3Q78IS1 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tmed3Q78IS1 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tmed3Q78IS1 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tmed3Q78IS1 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Tmed3Q78IS1 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tmed3Q78IS1 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tmed3Q78IS1 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tmed3Q78IS1 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tmed3Q78IS1 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tmed3Q78IS1 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tmed3Q78IS1 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tmed3Q78IS1 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tmed3Q78IS1 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tmed3Q78IS1 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tmed3Q78IS1 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tmed3Q78IS1 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Tmed3Q78IS1 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Tmed3Q78IS1 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tmed3Q78IS1 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tmed3Q78IS1 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tmed3Q78IS1 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tmed3Q78IS1 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tmed3Q78IS1 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tmed3Q78IS1 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tmed3Q78IS1 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tmed3Q78IS1 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tmed3Q78IS1 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tmed3Q78IS1 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tmed3Q78IS1 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tmed3Q78IS1 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tmed3Q78IS1 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Tmed3Q78IS1 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tmed3Q78IS1 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Tmed3Q78IS1 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tmed3Q78IS1 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tmed3Q78IS1 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tmed3Q78IS1 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tmed3Q78IS1 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tmed3Q78IS1 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tmed3Q78IS1 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tmed3Q78IS1 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tmed3Q78IS1 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tmed3Q78IS1 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tmed3Q78IS1 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tmed3Q78IS1 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tmed3Q78IS1 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tmed3Q78IS1 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tmed3Q78IS1 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tmed3Q78IS1 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tmed3Q78IS1 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tmed3Q78IS1 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tmed3Q78IS1 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tmed3Q78IS1 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tmed3Q78IS1 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tmed3Q78IS1 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Tmed3Q78IS1 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tmed3Q78IS1 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Tmed3Q78IS1 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tmed3Q78IS1 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tmed3Q78IS1 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tmed3Q78IS1 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Tmed3Q78IS1 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tmed3Q78IS1 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tmed3Q78IS1 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Tmed3Q78IS1 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Tmed3Q78IS1 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.7 ms