Protein–RNA interactions for Protein: Q76I25

Higd1c, HIG1 domain family member 1C, mousemouse

Predictions only

Length 96 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Higd1cQ76I25 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Higd1cQ76I25 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Higd1cQ76I25 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Higd1cQ76I25 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Higd1cQ76I25 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Higd1cQ76I25 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Higd1cQ76I25 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Higd1cQ76I25 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Higd1cQ76I25 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Higd1cQ76I25 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Higd1cQ76I25 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Higd1cQ76I25 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Higd1cQ76I25 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Higd1cQ76I25 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Higd1cQ76I25 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Higd1cQ76I25 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Higd1cQ76I25 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Higd1cQ76I25 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Higd1cQ76I25 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Higd1cQ76I25 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Higd1cQ76I25 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Higd1cQ76I25 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Higd1cQ76I25 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Higd1cQ76I25 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Higd1cQ76I25 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Higd1cQ76I25 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Higd1cQ76I25 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Higd1cQ76I25 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Higd1cQ76I25 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Higd1cQ76I25 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Higd1cQ76I25 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Higd1cQ76I25 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Higd1cQ76I25 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Higd1cQ76I25 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Higd1cQ76I25 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Higd1cQ76I25 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Higd1cQ76I25 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Higd1cQ76I25 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Higd1cQ76I25 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Higd1cQ76I25 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Higd1cQ76I25 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Higd1cQ76I25 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Higd1cQ76I25 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Higd1cQ76I25 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Higd1cQ76I25 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Higd1cQ76I25 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Higd1cQ76I25 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Higd1cQ76I25 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Higd1cQ76I25 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Higd1cQ76I25 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Higd1cQ76I25 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Higd1cQ76I25 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Higd1cQ76I25 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Higd1cQ76I25 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Higd1cQ76I25 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Higd1cQ76I25 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Higd1cQ76I25 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Higd1cQ76I25 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Higd1cQ76I25 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Higd1cQ76I25 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Higd1cQ76I25 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Higd1cQ76I25 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Higd1cQ76I25 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Higd1cQ76I25 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Higd1cQ76I25 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Higd1cQ76I25 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Higd1cQ76I25 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Higd1cQ76I25 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Higd1cQ76I25 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Higd1cQ76I25 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Higd1cQ76I25 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Higd1cQ76I25 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Higd1cQ76I25 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Higd1cQ76I25 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Higd1cQ76I25 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Higd1cQ76I25 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Higd1cQ76I25 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Higd1cQ76I25 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Higd1cQ76I25 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Higd1cQ76I25 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Higd1cQ76I25 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Higd1cQ76I25 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Higd1cQ76I25 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Higd1cQ76I25 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Higd1cQ76I25 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Higd1cQ76I25 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Higd1cQ76I25 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Higd1cQ76I25 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Higd1cQ76I25 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Higd1cQ76I25 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Higd1cQ76I25 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Higd1cQ76I25 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Higd1cQ76I25 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Higd1cQ76I25 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Higd1cQ76I25 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Higd1cQ76I25 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Higd1cQ76I25 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Higd1cQ76I25 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Higd1cQ76I25 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Higd1cQ76I25 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.8 ms