Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWV7

Rpl35, 60S ribosomal protein L35, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl35Q6ZWV7 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rpl35Q6ZWV7 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rpl35Q6ZWV7 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rpl35Q6ZWV7 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rpl35Q6ZWV7 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rpl35Q6ZWV7 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rpl35Q6ZWV7 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rpl35Q6ZWV7 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rpl35Q6ZWV7 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rpl35Q6ZWV7 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rpl35Q6ZWV7 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rpl35Q6ZWV7 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rpl35Q6ZWV7 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rpl35Q6ZWV7 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rpl35Q6ZWV7 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rpl35Q6ZWV7 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rpl35Q6ZWV7 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rpl35Q6ZWV7 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rpl35Q6ZWV7 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rpl35Q6ZWV7 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rpl35Q6ZWV7 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rpl35Q6ZWV7 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rpl35Q6ZWV7 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rpl35Q6ZWV7 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rpl35Q6ZWV7 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rpl35Q6ZWV7 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rpl35Q6ZWV7 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rpl35Q6ZWV7 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rpl35Q6ZWV7 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rpl35Q6ZWV7 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rpl35Q6ZWV7 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rpl35Q6ZWV7 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rpl35Q6ZWV7 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rpl35Q6ZWV7 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rpl35Q6ZWV7 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rpl35Q6ZWV7 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rpl35Q6ZWV7 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Rpl35Q6ZWV7 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rpl35Q6ZWV7 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rpl35Q6ZWV7 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rpl35Q6ZWV7 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rpl35Q6ZWV7 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rpl35Q6ZWV7 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Rpl35Q6ZWV7 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rpl35Q6ZWV7 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rpl35Q6ZWV7 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Rpl35Q6ZWV7 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rpl35Q6ZWV7 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rpl35Q6ZWV7 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Rpl35Q6ZWV7 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rpl35Q6ZWV7 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Rpl35Q6ZWV7 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rpl35Q6ZWV7 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rpl35Q6ZWV7 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rpl35Q6ZWV7 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rpl35Q6ZWV7 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rpl35Q6ZWV7 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rpl35Q6ZWV7 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rpl35Q6ZWV7 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rpl35Q6ZWV7 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rpl35Q6ZWV7 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rpl35Q6ZWV7 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rpl35Q6ZWV7 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rpl35Q6ZWV7 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rpl35Q6ZWV7 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rpl35Q6ZWV7 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rpl35Q6ZWV7 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rpl35Q6ZWV7 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rpl35Q6ZWV7 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rpl35Q6ZWV7 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Rpl35Q6ZWV7 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rpl35Q6ZWV7 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rpl35Q6ZWV7 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rpl35Q6ZWV7 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rpl35Q6ZWV7 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rpl35Q6ZWV7 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rpl35Q6ZWV7 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rpl35Q6ZWV7 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Rpl35Q6ZWV7 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rpl35Q6ZWV7 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rpl35Q6ZWV7 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rpl35Q6ZWV7 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rpl35Q6ZWV7 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rpl35Q6ZWV7 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rpl35Q6ZWV7 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rpl35Q6ZWV7 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rpl35Q6ZWV7 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rpl35Q6ZWV7 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rpl35Q6ZWV7 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Rpl35Q6ZWV7 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rpl35Q6ZWV7 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rpl35Q6ZWV7 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rpl35Q6ZWV7 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rpl35Q6ZWV7 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rpl35Q6ZWV7 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rpl35Q6ZWV7 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rpl35Q6ZWV7 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rpl35Q6ZWV7 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rpl35Q6ZWV7 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rpl35Q6ZWV7 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms